更多内容请访问个人公众号---KS科研分享与服务--- 接上节(跟着Cell学单细胞转录组分析(二):单细胞转录组测序文件的读入及Seurat对象构建[http://mp.w...
更多内容请访问个人公众号---KS科研分享与服务--- 接上节(跟着Cell学单细胞转录组分析(二):单细胞转录组测序文件的读入及Seurat对象构建[http://mp.w...
对于组数高于2组的,t检验不再适用,这时,方差分析适用 单因子方差分析(one-way ANOVA)We use the data,cholesterol,作为例子 完全随机...
欢迎关注”生信修炼手册”! 在之前的文章中,我们提到利用网络聚类算法可以从复杂的蛋白质网络中挖掘蛋白复合体或者相应的功能模块,其中MCODE算法是最常用的挖掘蛋白复合体的算法...
经常看到文章中有那种好漂亮的网络图,偶也想自己画一个呢,但是不会咋整呢? 别急,今天本椒就分享一下用cytoscape画互作网络图! 看一遍就会啦。。。还不会!那就多看几遍哈...
1.最常用的在线网站David: https://david.ncifcrf.gov/home.jsp 然后用R进行可视化 good:可以自行筛选GO/KEGG进行可视化 T...
由于之前提到软件版本的问题,所以以下分享是基于Cytoscape3.7.2的~ step1:导入string_interactions.tsv 文件,法1:load; 法2:...
先是画一个这个图 ,这个图是根据p.adjust(也就是FDR)来排序的,我的代码是按照queritem多少来排序的,颜色填充都是根据FDR来的 ##画直方图,先是数据集,设...
先在AgriGO[http://systemsbiology.cau.edu.cn/agriGOv2/specises_analysis.php?&SpeciseID=18&...
有一些已经做完了GO enrichment, 得到了结果,才发现很多软件都是直接给gene list做富集。如果已经完成分析,照样可以画图,代码如下: 原始文件示例:Anno...
1、安装 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManage...
1、安装R 先安装R语言,到官网https://www.r-project.org/[https://www.r-project.org/],点击download R,选择镜...