1. 什么是位点频谱(site frequency spectrum)? 位点频谱也叫等位基因频谱(allele frequency spectrum)是群体遗传学的术语,用...
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1. 什么是位点频谱(site frequency spectrum)? 位点频谱也叫等位基因频谱(allele frequency spectrum)是群体遗传学的术语,用...
检测基因组选择信号的方法有很多种,其中 XP-CLR 方法是常用的一种。XP-CLR 是陈华老师、Nick Patterson 和 David Reich 在 2010 年发...
conda activate seletioncd /cd mnt/d/peng/fst/xpclr-1 基因分型: for i in 1 2 3 4 5 6 7 8 9 1...
1 使用vcftool计算pi值 输入文件:SNP_qc0818.vcf,未LD过滤,若文件较大则过滤更好工作路径:/home2/yl/abi/Gorilla/fq_data...
假设我们想模拟经历了以下群体演化历史的群体样本: 我们在3popDNASFS.par文件中来描述这个群体演化历史的过程,这个演化过程是时间回溯的,从下往上依次来描述这个过程:...
Science 发表了题为“Dual domestications and origin of traits in grapevine evolution”的研究成果,并被选...
本文主要介绍hapFLK(FLK统计量)、LEA软件包(LFMM模型)和PCADAPT软件如何检测选择信号 总体的思想就是通过这几款软件、不同的算法计算出每一个位点的z-sc...
SFS的基本理解、介绍的一篇文章:https://theg-cat.com/tag/joint-sfs/[https://theg-cat.com/tag/joint-sfs...