测试单转+空转联合分析工具的文章 Benchmarking spatial and single-cell transcriptomics integration metho...
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rule 那块,可以直接用下面这个,便可以得到相同的结果:
# 使用染色体的颜色来定义link颜色
<rule>
condition = 1
color = eval(var(chr1)) # 使用第1条染色体来定义link颜色
# color = eval(var(chr2)) # 使用第2条染色体的颜色来定义link颜色
</rule>
gatk HaplotypeCaller用到的基因组文件名称结尾必须是.fa(.fasta应该也可以),否则会疯狂报错,用之前需要先bwa index创建索引,但是有时会发现...
最后的这个图,很喜欢😍
python的版本应该是2.7吧
应该是最好的eggnog-mapper功能注释教程eggnog-mapper实现功能注释 eggNOG-Mapper介绍 通常功能注释的思路都是基于序列相似性找直系同源基因,常见的方法就是BLAST+BLAST2GO, 或者...
pfam 寻找多个基因的domain tbtools需要的是 邮箱的文件,把空格替换成制表。
1.提取文件某一列的方法,在shell脚本里用awk: awk '{print $n}' filename > file_n.txt; 在awk的man手册里,可以找到很多参...
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tr 'a-z' 'A-Z' < txt1 ;不加<是会报错的,把小写替换成了大写字母。 tr -d 'a-z' <txt1 ;删除小写字母 tr -s 'a-z' <txt...
grep -f txt1 txt2 。文件1中的内容不要有空格,否则输出的内容只会在所有内容中高亮,并没有剔除其他的内容。 sort -u 去重 。 -r 倒序 -k 第几列...