featureCounts是一个用来统计count数的软件，运行的速度飞快，比之前用的htseq-count快了好多好多。 照例先说一下怎么下载这个软件： 然后来说这次的流程...
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Hisat2+FeatureCounts+DESeq2流程+作图！ -
转录组分析之Hisat2-featurecounts-DEGseq-GO/keggEnriched
1.索引建立 hisat2-build 基因组.fasta 输出结果文件位置 备选：根据比对的效果，可以另选多种比对方式，也可magicblast，那此时建立索引及比对，见 ...
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手把手入门--DESeq2差异基因分析准备工作 需要你先安装好R-3.6.0 、Rtools-3.5、Rstudio，这是基本的运行环境。 然后再此基础上安装DESeq2 的R包。 >Install.packag...
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测序数据比对到参考基因组
1.准备转录组数据 转录组数据可以从数据库中下载，也可以使用公司返回的测序数据，在服务器上下载完成后将原始文件名改为自己熟悉的格式，方便后期分析的进行。 2.准备样本信息表 ...
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DNA甲基化数据分析(二)DSS是一个R包，对基于计数的测序数据进行差异分析。 它可以检测来自RNA-seq的差异表达基因（DEG），以及来自亚硫酸氢盐测序（BS-seq）的差异甲基化位点或区域（DM...
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大家好，我叫杨俊伟，现就读于中国农业大学，在读博士，主要从事生物信息学方面工作。<br><br>人生格言：Take pains, be perfect
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DNA甲基化数据分析(一)Hi,大家好。最近在帮师姐分析甲基化，顺便就把甲基化分析过程整理一下。我们先来看看什么是DNA甲基化。DNA甲基化（DNA methylation）为DNA化学修饰的一种形式...
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DNA甲基化数据分析全流程
2021-01-01 更新 简单记录一下平时的分析过程 和RNA-seq前期流程类似 -- 质控、去接头、比对参考基因组、排序 后期就是要提取甲基化位点，包括CpG、CHG、...
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DNA甲基化Bismark、BSMAP流程跑起来日常掰虾 前面学习了DNA甲基化的基础知识，也了解了它的重要性，不知道的同学看这里，DNA甲基化知识概述[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz...
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『鹅厂号: 生信云笔记』分享生信分析及数据可视化相关的内容，欢迎关注和交流！<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2F1156054203.github.io" target="_blank">https://1156054203.github.io</a>
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WGBS+RNA-seq揭示AtSAMS通过DNA甲基化和乙烯信号通路协同调控植物花器官发育的表观遗传机制花器官是植物繁殖的关键结构，其发育受到严格的遗传调控。ABC模型是解释花器官发育的经典理论，其中A、B、C、E功能基因分别调控萼片、花瓣、雄蕊和雌蕊的形成。然而，这些基因的表...
