常用的细胞通讯软件：CellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/38a9376f5286]：是公开的人工校正的，储存受体、配体以及两种相互作用...
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单细胞分析之细胞交互-3：CellChat -
WGCNA学习：WGCNA分析实战WGCNA笔记第三弹 WGCNA分析原理 WGCNA应用场景 WGCNA分析实践 本代码借鉴了生信技能树的WGCNA教程以及PlanTech的WGCNA课程编写，转载请注明出...
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R语言接受命令行参数的三种方式
R语言接受命令行参数的三种方式 最近要用一下R的命令行，但是发现命令行参数不是很友好，就总结了一下目前常用的R的命令行参数的接受方法。 平常我们使用R语言的时候常常都是在交互...
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R Advanced Application（Manhattan+heatmap+facet+curve fitting）绘制曼哈顿图 横坐标为SNP在基因组上对应的染色体位点，纵坐标为-log10(P-value)。 曼哈顿图需要的原始数据应包含以下部分：SNP的ID（rs开头），染色体编号（...
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R Elementary Application （base+ggplot2）
💡 使用getwd("")来读取工作路径，使用setwd("")来更改工作路径→使用setwd("../")来将工作路径更改至上级目录 💡 使用dat<- read.tabl...
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R Intermediate Application（Venn+Pie+Volcano+Q-Q plot））
text文件的制表符格式为sep="\t"（即空格），是默认状态，但如果文件格式为CSV，则需要将sep转换为=","，如果文件格式为EXCEL，则需要使用R包xlsx，随后...
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RColorBrewer package与R的颜色RColorBrewer包存在三种类型的色板，单色渐变+双色渐变+离散颜色色板 色板的查看：display.brewer.all()查看所有色板；display.brewer...
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Basic R Knowledge
R主页：http://www.r.project.org/[http://www.r.project.org/**] R语言主页→software→package→可以下载多...
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使用uuid做MySQL主键，被老板，爆怼一顿！前言：在mysql中设计表的时候,mysql官方推荐不要使用uuid或者不连续不重复的雪花id(long形且唯一),而是推荐连续自增的主键id,官方的推荐是auto_incr...
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Graphpad绘制ROC曲线Graphpad绘制ROC曲线 接受者操作特性曲线（receiver operating characteristic curve，简称 ROC 曲线），又称为感受性曲线（s...
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TCGA数据差异分析后生存分析（批量单因素cox回归/Lasso筛选，多因素cox建模，时间依赖ROC曲线及KM plot可视化）测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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冷冻电镜(cryo-EM)三维图像重构软件Relion工作站配置推荐单颗粒冷冻电镜是结构生物学研究的重要手段之一，冷冻电镜的模型重构通常需要对几万甚至几十万张投影图片进行分析、组装和优化，计算量巨大，这需要先进的计算架构配合有效的算法...
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GEO数据库学习总结（一）数据下载
非常感谢jimmy大神与生信技能树一直以来的无私分享，自己学习的同时也伴随着记录，如有错误的，欢迎大家指正~~~~ 1.数据下载 Ⅰ、R代码直接下载数据 建议以Rdata形式...
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