100天生信-Day3 今天看到了洲更大神blast比对最优同源的方法(https://www.huaweicloud.com/articles/13536909.html[...
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100天生信-Day6 长数据和宽数据是满足不同分析的两种数据格式,可以很方便用R的reshape2包转换,代码如下: 参考教程:https://cloud.tencent....
将GeneID与GO号一一对应的两列表格,转换为同一GeneID对应GO号排一行(如图),主要使用字典、列表完成转换。 代码如下
100天生信-Day11 最近一直在做湿实验,需要大量设计引物,发现primer3有python版本,可以批量设计,简直神器。 参考教程:https://mp.weixin....
GO富集介绍每个基因都会对应有一个或多个GO term(也就是GO功能)。富集涉及到两个概念:前景基因和背景基因。前景基因就是你关注的要重点研究的基因集,背景基因就是所有的基...
100天生信-Day5 ChIP-seq、ATAC-seq等需要在全基因组上找到特定位置的结合/切割/富集的高通量测序技术,都需要进行reads比对后的peakcalling...
最常用的Linux循环应该是for和while,记录两个直接输入command的实例(输出Ta开头的所有文件名字): 开始正片:使用同一个query批量blast文件夹下所有...