安装: 构建注释库 (1)由于课题中加了点变动,注释信息有些改变,需要自己创建库 首先 在snpEFF 文件夹下创建data 文件夹 (2)随后在里面分别创建 genomes...
最近在学习plink软件的用法:用到什么就查一些东西,零零碎碎,整理一下,当做备份。 plink --file data --recodeAD --recode-allele...
最近要开始做一个分类器,因此,参考了几篇文献,并在自己的数据上进行了测试,可用。1. 数据当然了,需要准备两个数据集合,一个数据集合作为训练集合(train_dat),另一个...
copynumber 是一个功能强大拷贝数分析工具,这里仅限于自己用的的部分功能,看到可用hg38版本,就尝试运行了一下,识别CNV break points。
最近安装tensorflow 总是很慢,找了几个镜像,自己备份一下,在linux 服务器上安装时,记得用https pip3 install --user -i http...
在安装时,使用conda 进行安装, conda install -y breakdancer 安装完,运行 bin/bam2cfg.pl 报错 是没有安装这个Statist...
要玩图,离不开哈德雷大神的《R数据科学》,第1章和21章是专门讲图的,我写过对应的笔记:https://www.jianshu.com/p/4a154f6f0de7https...