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    2019-11-12 听课笔记之蛋白质组学研究方法概述(上)

    转发自http://crickcollege.com/news/167.html 写在前面从10月底开始,由克里克学院与康昱盛主办的蛋白质组学网络大课堂正式开班了,整个课程由...

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    2019-11-12p值、E值、FDR、q值…你晕菜了吗?

    转发自http://crickcollege.com/news/97.html 上一篇关于质谱搜库的推文发出来后,很多小伙伴都发消息给我们说,常常被质谱鉴定中的各种统计学指标...

  • 变量交互模式(即分子间调控问题)

    两大经典调节 1.miRNA调节mRNA 2.转录因子TF/激活子(促进转录),主要是可调节性转录因子 思路:当某一基因高表达时自然会想到是不是由于转录因子的高表达导致基因的...

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    三元变量论证逻辑

    口诀:先辨主次,再分上下,两两调控,三三回复 一、药物+分子(创新点)+通路(间接作用机制) 核心:主变量是谁?被上游哪个因素调控,影响下游哪个因素先两两配对证明调控关系,再...

  • 二元变量论证逻辑

    1.研究分子机制(只有一个主变量) 核心:它调控了谁(即下游的明星分子或者通路),它被谁调控(即上游的驱动因素,一般是分子或者药物) 2.药物+通路 已知药物怎么找通路 3....

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    分子修饰(变量纵向展开)

    为什么要讲分子修饰:因为分子是我们研究的主变量,但是分子本身就是千变万化的 分子本身千变万化(分子修饰) 表达怎么在疾病中发生变化? 同一分子的不同阶段:DNA,RNA,蛋白...

  • IncRNA和circRNA 的研究套路

    IncRNA:长链非编码RNA,是长度大于200个核苷酸的非编码RNA。近年来的研究表明IncRNA能在表观遗传、转录及转录后水平上调控基因表达,参与X染色体沉默、基因组印记...

  • 基本概念和基础复习

    DNA 复制 https://mp.weixin.qq.com/s?src=11&timestamp=1587299931&ver=2288&signature=hCLim9...

  • miRNA的研究套路

    miRNA:微RNA是真核生物中广泛存在的一种长约21到23个核苷酸的高度保守的非编码RNA分子,可调节其他基因的表达。成熟miRNA还需要与Argonaute蛋白等组装形成...

  • 文献阅读

    文章的基本结构 **figure1是组织和细胞表达的数据figure2是细胞水平功能研究小图a提供过表达或沉默有效figure3

  • 思路

    研究的总的模式 1.确定所要研究的疾病和表型2.筛选所要研究的分子(具体见三变量)3.设计实验①根据分子选择相应的模型②通过分子上调和下调观察其与表型之间的关系(1)对于基因...

  • 常用的资料库

    1.数据库索引网站 omictools2.查看分子特征:Geencards3.怎么查基因和蛋白序列:NCBI 的gene数据库(检索基因),nucleotide数据库(检索R...

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    基础科研三变量

    分子:在什么疾病中分子能够介导某个表型通过上调(质粒,病毒)某个基因的表达观察其表型变化通过下调(RNAi, )用过一正一反来回验证通路:一般用于解释机制,不作为主变量一定要...

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    一些研究手段科普

    1.过表达基因 基因过表达的基本原理: 是通过人工构建的方式在[目的基因]上游加入调控元件,使基因可以在人为控制的条件下实现大量转录和翻译,从而实现基因产物的过表达。 ①细胞...

  • 前辈方法

    少而精,眼界广,交流强 一.疾病和表型之间连线关系(定位): 1.读所在领域大牛进5年的review,了解大家都在干什么2.一个方向内的国自然基金题目,记录题目疾病和表型之间...

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    基础科研五变量

    疾病:就是临床问题表型:是科学问题(一个科学问题可以包括多个表型)疾病和表型相当于经纬度,决定研究方向疾病和表型的连线关系模型:科学家已经创造出来,或者文献里面直接存在了,可...

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    测序

    测序:每个物种的基因控制生物性状的表达,而测序是指对基因的序列进行判断。思路:疾病一般来说主要是在分子水平发生了改变,如何知道分子水平发生了改变?1.知道正常的序列是什么样的...

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    学习小组Day6笔记

    什么是R包?R包是多个函数的集合,具有详细的说明和示例。不同的R包具有不同的功能。 R包的安装install.packages(“包”)——要安装的包存在于CRAN网站Bio...