相关成果发表在NAR，Zijie Jiang, Zhixiang Peng, Zhaoyuan Wei, Jiahe Sun, Yongjiang Luo, Lingzi B...
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AutoHIC 自动纠正HiC挂载结果
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一文了解Count、FPKM、RPKM、TPM | 相互间的转化 | 收藏教程
PS：如果你需要本教程的练习代码和文档，可以在公众号回复“20220122”即可获得。 前言： 今早看到一篇博文，提到了FPKM与TPM间转化。我自己也系统的再次进行整理一下...
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FPKM、RPKM、TPM还在傻傻分不清？FPKM：Fragments Per Kilobase of exon model per Million mapped fragments(每千个碱基的转录每百万映射读取的...
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ROH、近交系数、亲缘系数、IBD、IBS连续纯合片段（runs of homozygosity, ROH）是亲代将同源相同的单倍型传递给子代而形成的，基于ROH计算的基因组近交系数是个体真实的近交系数，它比传统系谱...
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有些软件总能以某种方式劝退你 | SpectralTAD 之 TAD calling序 言 有些软件总能以某种形式劝退你，让你毫不犹豫的投入其他软件的怀抱，外加产生一种不吐不快的情愫，激发一种唯恐他人也会“遭此毒手”的正义感。软件之所以叫做软件，大抵是因...
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笔记：rmats绘图结果怎么看rmats是一款比较好的分析可变剪切的分析软件，将rmats分析的结果，利用rmats2sashimiplot绘画出的图也是比较漂亮的， 可变剪切事件： 可变剪切事件可以分为...
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【最新汇总】单细胞转录组分析与绘图系列
分析 单细胞分析实录(1): 认识Cell Hashing[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkzMzE5NTM4NA==&mid=2247...
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这个链接里介绍了很多关于基因组学可视化工具的内容
https://cmdcolin.github.io/awesome-genome-visualization/?latest=true[https://cmdcolin.g...
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TEclass | 对TE一致性序列进行分类软件安装 软件地址在http://www.compgen.uni-muenster.de/tools/teclass/index.hbi?[http://www.compge...
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10×单细胞测序分析练习（一）目前单细胞测序获取细胞的方法主要有两种：（1）Smart-seq：测序细胞量少(因为一次通过一个细胞)，但是测序的reads数多；（2）Drop-seq(10X )：可以测许...
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单细胞测序分析: Seurat 使用教程原文见Seurat - Guided Clustering Tutorial, Compiled: April 17, 2020 #1 Seurat安装 #2 数据下载 Pe...
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rGREAT | 基因组区间功能富集背景 GREAT(Genomic Regions Enrichment of Annotations Tool)是一种广泛使用的基因组区域功能富集工具，该工具于2010年...
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只需2行代码，轻松将PDF转换成Word
可将 PDF 转换成 docx 文件的 Python 库。该项目通过 PyMuPDF 库提取 PDF 文件中的数据，然后采用 python-docx 库解析内容的布局、段落、...
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单细胞分析入门——一套经典的Seurat分析流程前几天看到周运来老师的一句话，放在这儿，与诸君共勉： 看到才能想到，想到才能做到，做到才能得到，得到才能失去，只有失去了才知道适不适合自己 好了，切入正题，今天想给大家分享的...
