本节概览:数据预处理, 进行样本间具有可比性boxplot查看样本的基因整体表达情况查看不同分组的聚类情况:样本hclust 图、距离热图、PCA图、差异基因热图、相关性热图...
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前言 作为最大的双子叶植物科,菊科包含各种经济作物、观赏植物和许多药用植物。基因组学和转录组学的进步彻底改变了菊科物种的研究,产生了大量的组学数据,需要一个高效的数据整合和分...
先下载 primer3 和 misa 相关文件 misa 相关文件放在百度云链接:https://pan.baidu.com/s/1C4eU30yyLr7iNGiuGEmPt...
文章标题:MMseqs2 enables sensitive protein sequence searching for the analysis of massive d...
RNA-seq数据分析 我们对工具和技术的评估落脚点在它们鉴定出的差异基因的准确性。为了完成这个评估,至少需要四个不同的分析阶段(图2;表2)。第一阶段把测序平台生成的原始测...
Homolog是同源基因。 Orthologs,Orthologues 直系同源,是指不同物种之间的基因,起源于共同的祖先,基因功能可能一样,但又因为进化的关系,使得功能有...
Logs 增加R包pctax内的一些帮助上游分析的小脚本(2024.03.03) 增加Mmseqs2用于去冗余,基因聚类的速度非常快,且随序列量线性增长(2024.03.12...
更新 查看新版:宏基因组分析流程(Metagenomic workflow)202405|持续更新 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jiansh...
文献 2023 PNAS Genome evolution and initial breeding of the Triticeae grass Leymus chinen...