一 :hisat2流程 HISAT2安装及使用[https://blog.csdn.net/msw521sg/article/details/52527205] hisat2...
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文献 2019 PNAS Comparative transcriptomics method to infer gene coexpression networks and...
原网址:https://cloud.tencent.com/developer/article/1626413 对于不同的HLA Allel来说,exon2和exon3 序列...
之前写过 一套比较简便的基因组组装流程[https://www.jianshu.com/p/a736b1b4b188],时间快2年了,现在新技术,新方法出来了,有更好的的方法...
原理:基于不同建立经过纳米孔时,电流信号的差异典型应用: 读长比较长,利于拼接 解决动植物多倍体高重复、高杂合的特性 也适用于细菌拼接 对RNA直接测序,无需反转录,直接识别...
1.Bolognini, D. & Magi, A. Evaluation of Germline Structural Variant Calling Methods fo...
基因组结构注释主要包括三个方面:从头注释(de novo prediction)、同源注释(homology-based prediction)以及基于转录组数据注释(tra...
比较软件: Jellyfish 2.3.0 KMC 3.2.1 使用数据:大肠杆菌基因组 但是histo文件似乎有一些不一样。 1、jellyfish的Kmer频数统计 2、...
主要利用mummer和NgenomeSyn进行,可以同时绘制多个基因组 首先准备基因组文件(fasta)用于比对使用mummer4.0进行比对操作,mummer的配置参见ht...