转录组Read Counts统计原理： 一般来说是通过比对工具（如HISAT2、STAR，fanse）将测序reads比对到参考基因组使用计数工具（如HTSeq、featur...
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NGS原理- 转录组计数统计Readcounts-如何才是合理的
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2025-06-16 Samtools 工具最详细介绍
以下是对 samtools 各命令的详细中文解释及其拓展应用场景，结合功能分类和实际生物信息学分析需求整理： 一、索引命令（Indexing） dict功能：创建参考基因组的...
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为什么要做这样一款用于植物基因功能注释的软件？
在开篇，我觉得应该首先和同学们说一下如题所示的问题。我发现到目前为止，可用于基因功能注释的网站还是有很多的，但绝大多数网站所收录的植物物种实在太少而植物各物种差别又太大。举个...
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你知道地球上有多少种生物吗？DNA条形码技术告诉你！欢迎来到今日的《科学快报》 地球上和海洋中究竟有多少物种？——从DNA条形码看生物多样性 相关研究来源于PLOS Biology期刊。 你是否曾经好奇地想知道地球上和海洋中到...
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2025-06-16 samtools的极简生活+ 性染色体分析PSASS安装
今天，66大顺。祝大家科研顺利，万事顺心！ psass用的人不多，所以觉得说不定可以分享一个文章，说不定有人感兴趣。 psass前几日安装一直不顺，没想到今日直接装成功了，都...
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IQtree：使用 SNP 数据构建系统发育树IQ-tree也是一款最大似然法构建进化树的软件，目前IQ-tree已经更新到2.0版本功能和性能也有很大的提升，主要有四大功能，高效建树（efficient tree re...
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snpEff注释水稻基因组1安装方法 首先安装好java环境，通过官网下载最新版本的软件压缩包，然后解压即可，最好安装在自己熟悉的目录下。 java检测 java -version 配置数据库 有一些...
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入门Hifiasm?这一篇就够了Hifiasm 使用教程 介绍 Hifiasm 是一个快速的单倍型解析 de novo 组装软件，最初设计用于 PacBio HiFi 读取。其最新版本可以通过利用超长的 O...
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MG2C教程-点点鼠标就能完成画图MG2C是一个很纯粹的工具。没有广告，没有推广，不考虑任何利益，纯属业余爱好。 MG2C是一个很“肤浅”的工具。打开使用界面，参数、输入和输出都在一个界面，看一眼界面就相当于...
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不错，拿到MH的宣传册，里面看到你文章的宣传摘要，就来搜一下，看到作者了，谢谢你开发这个小公举😄
MG2C教程-点点鼠标就能完成画图
MG2C是一个很纯粹的工具。没有广告，没有推广，不考虑任何利益，纯属业余爱好。 MG2C是一个很“肤浅”的工具。打开使用界面，参数、输入和输出都在一个界面，看一眼界面就相当于...
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2024-11-07 籼稻粳稻基因组共线性分析-jcvi需要看下Nip和9311的基因匹配的有多少，思来想去，blast还是有点缺陷的，可能匹配到其他染色i他，需要用gff来帮助定一下位。所以，用基因的共线性分析看起来更合适一点。...
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@顾大师 先配置好该配置的所有的，然后再装软件试试？
好久了，我也忘记了2019-08-01 SMRTlink7.0 安装超不顺利。。。
可参考安装流程：https://vcru.wisc.edu/simonlab/bioinformatics/programs/install/smrt.htm遇到问题1 查找...
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2024-06-03 AI拆解高通量数据的批次效应去除pycombat包
1. 介绍 这个代码实现了一个名为Combat的类，该类用于数据的批次效应校正。Combat (ComBat) 是一种广泛应用于基因表达数据和其他高通量数据的批次效应校正方法...
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这种渣渣还不挂出来实名鞭尸，妹子你真是发自心底的善良啊
关于简书笔记的一些想法
在简书上做笔记已经快两年了，在记录笔记的过程中自己学到了很多，同时也想把自己看到的知识分享给有同样需要的人。然而在这个过程中，也让我见识到了各式各样的人。有很多同学发简信和我...
