发简信
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📚UTMOST(跨组织转录组关联研究)+FUSION+FOCUS+MAGMA+孟德尔视屏简介 UTMOST(跨组织转录组关联研究)+FUSION+FOCUS+MAGMA+孟德尔随机化_哔哩哔哩_bilibili[https://www.bilibili.co...
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📚性状/疾病间的共同遗传研究项目内容 流程简介 软件安装 参考数据介绍 GWAS数据 安装Fast2TWAS包 GWAS数据的预处理 LDSC计算遗传相关性 LDSC计算partitioned heri...
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📘孟德尔随机化之Exposure data
一、暴露因素的数据要求： 1.对于暴露因素的GWAS数据，TwoSampleMR需要一个工具变量数据构成的data frame，每行对应一个SNP，至少需要4列，分别为： S...
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📘孟德尔随机化之Introduction
1. 安装孟德尔随机化分析相应的R包 2. 概述： 孟德尔随机化流程如下： 选择暴露的工具变量（筛选显著的SNP[P < 5e-8]，并进行LD clumping分析，【计算...
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PWAS+TWAS+共定位+孟德尔随机化(适用于精神以及脑部疾病)【新课发布】TWAS简介 全转录组关联分析 (TWAS, transcriptome-wide association studies) 是把转录调控（expression）作为遗传变异...
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孟德尔随机化--初筛孟德尔随机化--初筛 各位观众老爷们大家好，欢迎来到蟹道人的生信小课堂！ 本节内容我们主要讲解如何进行孟德尔随机化暴露与结局的快速初筛。 主要列举以下几个方法： 基于我自己写...
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医学生，公众号“生信与临床”，欢迎大家关注。<br><br>
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请教一下，如何计算总的R2，和总的F统计量
复现一篇高分(IF = 11.274)孟德尔随机化分析文章-day3
话不多说，直接上代码 部分结果展示 step 5. 所有SNP的F-stat值都大于10，因此都纳入分析中 step 6. 异质性检测结果 p = 0.3858222 > 0...
