发简信
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介绍
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hicPro+EndHiC(二)染色体挂载
EndHic 想比较HiC-Pro，EndHic的安装就简单很多，就是下载即可用 EndHiC的安装 要用到的脚本都在文件夹下，直接调用就行 怎么使用呢？不得不说一下，git...
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卑微的生信人，如果我的帖子对你有帮助，麻烦点点赞哦
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并没有看到与疾病如何关联的分析过程
hdWGCNA系列推文（二）：分析单细胞转录组数据
前言 Immugent在hdWGCNA系列推文第一篇：hdWGCNA：将单细胞和空间转录组的WGCNA分析变成现实[https://mp.weixin.qq.com/s?__...
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4 比对到参考基因组输出bam文件
进到align目录对质量好的测序数据进行比对 1. 一个个比对，生成BAM文件 align目录 不用-R参数也可以执行，但后面gatk的时候会报错 2或者循环批量比对 增加第...
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3_0_4 要理解并会用的几个脚本
这个介于3和4之间，目的是练习几个有用的脚本，学几个命令。 随便找几个文件进行练习，只是为了说明问题，这些其实是RNA-seq数据，但无所谓，只是看脚本的处理有以下几个文件 ...
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3 wes测序质量的控制原视频6:测序质量的控制首先建立文件夹 这部分包括fastqc和multiqc两个软件查看测序质量，以及使用trim_galore软件进行过滤低质量reads和去除接头。 1...
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hdWGCNA：单细胞WGCNA分析方法WGCNA原理和分析流程[https://www.jianshu.com/p/9331eb5377d1] 单细胞WGCNA分析方法+随机森林[https://www.jian...
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如何合并两个或多个bed files
目的：把两组bed files 分别pool成一个bed file，而且叠加到序列区间要merge起来。合并：cat *.bed > output.bed软件：需要 bedt...
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UKBB数据下载流程（第一节）
从今天开始，我又要经常回到简书记录一些数据下载，处理流程了。目前需要UKBB的GWAS， 用的人很多，都是大文章，大手笔。我没有找到怎么下载的。所以打算自己跟着帮助文档学习一...
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phesant（PHEnome Scan Analysis Tool）想着好久没更新了，但我的粉丝们还是会经常来看看我，所以，决定把最近学的东西挂出来。 搜了下中文网，几乎没有对这个方法进行介绍的，一个可能是新出的，一个可能是手里没有大样本，不...
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起个详亮的名字 ·Note that if Boost is installed in a non-default location then its path should be specified with BOOST_ROOT in the cmake command above:
$ cmake -DBOOST_ROOT=/path/to/boost/ ..
If all of the above steps were successful, the build directory now contains ExpansionHunter executable.
