最近在做一个SCENIC 下游的分析，看到了一个叫CSI（Connection specificity index）的东西，大概的原理就是利用AUC的分数通过pearson相...
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无知者无畏
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2019-08-20 【三代测序】有参转录组注释评估软件 MatchAnnot
matchAnnot iso-seq注释软件 https://github.com/TomSkelly/MatchAnnot MatchAnnot is a python ...
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pacbio 三代全长转录组数据分析流程Iso-seq基础概念，转载自https://blog.csdn.net/weixin_34384681/article/details/85937505[https://b...
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Chicdiff使用Capture Hi-C 是一种检测至少在一端涉及感兴趣的 DNA 区域，如基因启动子染色体相互作用的有效方法。 Chicdiff，是一个用于捕获 Hi-C 数据中差分相互作...
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基于barcode拆分二代序列
为了节约成本，研究者们通常会把多个样品混在一个文库，并给不同样品加上一段 Barcode 序列。在后续的生物信息分析中，根据 Barcode 序列即可将不同样品的序列拆分开来...
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BUSCO 评估基因组组装质量和完整性工具使用BUSCO是Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs（通用单拷贝同源基因基准）的缩写，基于基因进化（有参比对）评估基因组组装和...
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跟着NC做基因组数据分析本期内容为[跟着NC做基因组数据分析]，这是你需要的教程，对你一定有帮助。 前言今天花费找文章，看到一篇关于基因组，组装的文章，主要是里面的图吸引了我的关注。后面仔细一看，作...
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GSAman | 目标染色体区间的快速基因结构注释前述，IGV-GSAman 的功能已经更新七七八八，基本可以满足绝大多数情况下的基因结构注释矫正工作需要。不过，我最近带娃比较多，这些时候做不了事情，也只能想一些旁门左道。大...
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基因组结构注释软件列表
基因组结构注释主要包括三个方面：从头注释（de novo prediction）、同源注释（homology-based prediction）以及基于转录组数据注释（tra...
