前言 对质谱数据做单变量的组间差异检验后，我们获得了检验的结果。常用展示结果的方法有图和表的方式，我们在文献中常用图来展示，而表可作为附表补充图。 本文讲使用火山图，韦恩图和...
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R可视化：组间差异结果的可视化 -
2018-08-29用R分析蛋白质组学数据（1）：数据获取和清洗R在RNAseq和基因组关注的比较多，在蛋白质组研究中虽然用的多，但是专门的博客和文章比较少，转载一个蛋白质组学数据分析的文章。原文见https://datasciencep...
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cMAP新版clue的使用——Touchstone
之前在Connectivity Map(cMap)的探索应用（二）中提到了两种cmap在线分析网站，一个是build2 ；另一个是CLUE平台。bulid2在cMAP在线分析...
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2025-02-02
首先安装homebrew,然后是macfuse，安装macfuse完成后，重启电脑,进入安全设置界面，具体见该链接， 67【macbook上移动硬盘无法读写？-活泼勇敢|小红...
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如何将WGCNA导出的基因共表达网络进行可视化（cytoscape软件的使用）WGCNA分析过程中，你可以得到edge和node的文件，里面有你某一个module里所有基因相互之间的connectivity的weight值，根据这些值你可以将它们之间的...
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基因表达趋势分析-2：Mfuzz基因表达趋势分析-1：TCseq[https://www.jianshu.com/p/b808085c7351] Mfuzz能够识别表达谱的潜在时间序列模式，并将相似模式的基...
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Mfuzz——时间序列聚类Mfuzz 工具采用模糊 c 均值聚类（Fuzzy C-Means Clustering，FCM）算法，根据具有时间序列特征的转录组、蛋白质组数据中基因或蛋白表达的时间趋势，...
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RNA-Seq 分析流程：多时间点样本分析实战（一）RNA-Seq 分析流程：多时间点样本分析实战（一） 小鱼爸 2023-07-12 简介 了解基因表达的时序动态变化是生物学的一个基本问题。此教程提供了多时间点数据的分步实战...
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在Linux中，将安装好的软件添加到环境变量可以通过两种方法实现
在Linux中，将安装好的软件添加到环境变量可以通过两种方法实现：将软件所在目录添加到环境变量的PATH中，或者复制软件到已经在环境变量中的目录。每种方法都有其优缺点，具体取...
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双端测序中read1和read2的关系在跟着健明老师学习生物信息学的过程中，少走了很多弯路，躲过了很多坑，在指导下浅尝过一些。但是自己常常扣原理，又双叒叕落坑，百思不得其解。以下是之前遇到的问题，今天整理带大...
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@天涯清水 请问R的端口是什么呀？网上搜到Rstudio是8787，我设置了允许通过防火墙但是还是无法访问，可能还是需要两个都设置😭但我没找到R的端口是什么
Error: Bioconductor version cannot be validated; no internet connection?-2019-06-19
软件安装 出现如下错误： Error: Bioconductor version cannot be validated; no internet connection? 按...
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生物软件1-Hisat2安装apt-get安装 需要root权限 安装结果 源码安装 进入Hisat2下载界面https://daehwankimlab.github.io/hisat2/downloa...
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samtools的安装和使用--------------- Nickier 2018-12-21 --------------- samtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集。能够实现二进...
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另一个悲催的事情。。。安装不了 包呜呜呜，换镜像也没用呜呜呜😭
rstudio-server安装报错终于解决了！
今天想在服务器上安装rstudio-server，搞了好久好久，一直报错！！ 最开始是报错： Dependency isnot satisfiable: libssl1.0....
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rstudio-server安装报错终于解决了！今天想在服务器上安装rstudio-server，搞了好久好久，一直报错！！ 最开始是报错： Dependency isnot satisfiable: libssl1.0....
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蛋白质组学知识背景及分析流程蛋白质组知识背景 蛋白质组(proteome)：由一个细胞、一个组织或一个机体的基因组所表达的全部相应的蛋白质，是一个整体的概念。 蛋白质组学(proteomics)：以蛋白...
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@可能性之兽 好的，谢谢LZ！
DESeq2的多组比较
DESeq2 multiple group comparison (biostars.org)[https://www.biostars.org/p/357464/]说来也神...
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就是文件名为A_vs_B，是A为对照的结果吗，纯纯小白，希望LZ可以回答一下，感谢🙏
DESeq2的多组比较
DESeq2 multiple group comparison (biostars.org)[https://www.biostars.org/p/357464/]说来也神...
