今天给大家带来一个老套路文章，文章分析方法其实都是大家已经司空见惯的方法，但是它为啥能发到6分多，让我们一起去探个究竟~ 研究背景 目前已经有研究表明，TP53突变可预测胃癌...
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快捷查找KEGG里的通路和基因
需求 1.快捷查找ID对应的description，知道通路对应的编号是多少。2.找出某一个/几个通路里的全部基因，用来做单独的下游分析。 如果是要做KEGG的富集分析，cl...
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RAEdb:基于STARR-seq和MPRA数据的enhancers和Epromoters可视化
欢迎来到"bio生物信息"的世界 1 前言 尽管之前已经有很多的数据库收集了enhancers，比如EnhancerAtlas、 VISTA Enhancer Browser...
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每日一图Marginal Histogram/Boxplot原文链接Top 50 ggplot2 Visualizations - The Master List (With Full R Code) If you want to s...
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GEO数据库的id转换尝试过两个方法下载探针矩阵数据：1.GEO网站直接下载txt。 probeMatrix<-read.table("GSE16011_series_matrix.txt",se...
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20201108-转录因子
什么是转录因子 转录因子（Transcriptionfactor，TF)是一个能与特异DNA序列结合的蛋白,可以单独或与其他蛋白形成复合体，提高或阻断特性基因对RNA聚合酶的...
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limma 差异分析透彻讲解基因表达差异分析是我们做转录组最关键根本的一步，edgeR+limma是目前最为推荐的方式。本文结合示例数据，将对这个过程进行梳理，让你明白limma包的why，what，h...
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文献笔记Detection of Microbial Infections Through Innate Immune Sensing of Nucleic Acids.Tan, X., et al. （2018）. "Detection of Microbial Infections Through Innate ImmuneSensing...
