准备 1.基因组序列下载与注释，使用prokka进行注释，获得gff文件。参考我前一篇：autoprokka:使用prokka批量注释 - 简书 (jianshu.com)[...
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利用泛基因组挖掘目标细菌的靶标基因-Roary,gbksplit和TBtools -
为了让所有人都轻松完成「基因差异表达分析」.....写在前面 在「基因差异表达」分析这件事情上，说实话，「TBtools」真的做了不少简化工作，大体如下： 做了 Rserver.plugin 做了 DESeq2 Wrapper...
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全基因组关联分析(GWAS)protocol全基因组关联分析（Genome-wide association study，GWAS）是应用基因组中数以百万级别的单核苷酸多样性（Single Nucleotide Plo...
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基因组结构注释软件列表
基因组结构注释主要包括三个方面：从头注释（de novo prediction）、同源注释（homology-based prediction）以及基于转录组数据注释（tra...
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细菌完成图+比较基因组分析再添好文！期刊：《Frontiers in Microbiology》 影响因子：5.640 近日，派森诺生物与上海交通大学农业与生物学院合作，在微生物基因组领域《Frontiers ...
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全基因组关联分析学习资料（GWAS tutorial）
https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/11803311.html 全基因组关联分析学习资料（GWAS tutorial）20210313更...
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10×一个样本测多少数据量(G)合适？
首先，需要明确一点: 数据量大小其实就是碱基的个数。那么，数据量大小的计算方法是： 单端测序数据量=reads长度 * reads个数 (reads长度很容易得知，reads...
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