发简信
IP属地：重庆
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公众号：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2读研，学习方向：癌症基因组、肿瘤免疫、单细胞组学
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WB实验问题总结（Western blot蛋白质印迹）
1.为什么我的细胞提取液中没有目标蛋白？ 答：原因有很多： a) 你的细胞中不表达这种蛋白质，换一种细胞； b) 你的细胞中的蛋白质被降解掉了，你必需加入PMSF，抑制蛋白酶...
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基因转录调控
顺式作用原件： DNA序列，位于基因序列的上游或下游，不编码蛋白，仅提供作用位点 「启动子，增强子，调控序列」 反式作用原件： 调控基因表达的蛋白质分子 「GTF，TF，ac...
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组蛋白甲基转移酶SETD2 - MedChemExpress
近日，中国科学院上海营养与健康研究所秦骏课题组与陆军军医大学大坪医院江军主任、南京医科大学王晓明教授的合作在Cancer Cell在线发表了题为 “SETD2 Restric...
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如何通过CHIP-seq分析鉴别基因启动子和增强子
一、表观遗传学的组蛋白修饰 染色体一个核小体由两个H2A，两个H2B，两个H3，两个H4组成的组蛋白八聚体和147bp缠绕在外面的DNA组成。组蛋白有很多修饰形式，包括组蛋白...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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ChIP-seq实践（非转录因子，非组蛋白）在实战之前，首先对CHIP-seq分析做一些了解，以下是从各个地方copy过来综合起来的，有些散乱，是我认为重要以及应该了解的知识点。chip-seq 实战就跟在转录组和外显...
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使用deeptools生成ChIP-seq信号热图与谱图整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。 deeptools 提供了computeMatrix命令以计算特定基因组...
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生信技能树，生信菜鸟团，jimmy
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记录学习生信的点滴
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收集一些生物信息学的分析流程的文章。感谢这些简友整理的生信分析流程！ 如果简友投稿没有被我收入专题，可能是我没看到或者收入到其他针对性更强的专题中了。望见谅！ 🕛🕐🕑🕒🕓🕔🕕🕖🕗🕘🕙🕚 文章的收录是有顺序的，查看的时候请点击“最新收录”然后进行查看。 👣 全基因组测序(WGS)分析 👣 转录组分析RNA-seq的分析流程 👣 染色质免疫共沉淀技术ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 👣 单细胞scRNA-seq分析 👣 癌症的预后标志物查找 👣 系统发育演化进化树构建与分析 👣 群体遗传学分析 👣 全基因组关联分析(GWAS) 👣 基因家族的分析 👣 甲基化测序与分析 👣 KEGG/GO功能富集分析 👣 图形绘制具体细节的比如热图、曼哈顿图的绘制等 👣 python、perl、R的包的使用过程 👣 具体工具的使用，比如GATK的使用过程 👣 数据库的挖掘方法，比如TCGA数据库的使用 👣 另外就是整个文章走下来的流程 👣 👣 👣
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