将路径加入到PATH中即可,vim ~/.bashrc 最后加上 export PATH=/home/wulab/bin/blender:$PATH,把/home/wulab/bin/blender换成你的路径即可
bedGraphToBigWig下载和使用bedGraphToBigWig是将bedgraph格式转化为BigWig格式的小工具 执行
将路径加入到PATH中即可,vim ~/.bashrc 最后加上 export PATH=/home/wulab/bin/blender:$PATH,把/home/wulab/bin/blender换成你的路径即可
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1.windows访问ubuntu文件 1.直接定位ubuntu文件夹,使用everything搜索2.可以直接复制文件到所需文件夹 Ubuntu访问windows文件
前言 开题啦,所以需要整合自己之前处理过的数据包括可视化作图,在GALAXY上翻到DeepTools正好有着一点用处,适当的搞了一波事情,顺带记录一下。GALAXY上可以可视...
BED BED是一种可以用UCSC等基因浏览器查看的基因注释文件格式,若大于50M,则应使用bigBed格式前三列染色体号,开始位置和结束位置必须,剩余九列为可选项。 如图,...
https://www.cnblogs.com/hum0ro/p/9781390.html
matplotlib库之patch patch适用于绘制各种形状相关的图形 通过设置facecolor, edgecolor, 以及color参数等实现不同的颜色填充 随机生...
fill可以填充两条线之间的色彩 结果如图 fill_between填充x轴与两条y轴 fill_between可以x轴可以通过截取片段进行限制,如x[0:1]等;fill_...
使用conda安装可以避免版本不匹配问题 由于书上已经提供了使用以上三种包分析的R脚本,直接下载
生成时,bam文件应该先排序 按理说bedgraph已经生成,但上传带UCSC却不对 在文件开头标注格式 上传后 用lunix标注
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awk格式 awk [options] BEGIN 'scripts' END file 变量定义 注意:1.\t:使用时使用“”;2.使用变量要加-v,变量可以内部使用 p...
1.怎么判断一个chip-seq峰(peak)? 实际上并没有一个确切的定义。A “peak” is what a “peak-finder” finds,峰很大程度取决于使...
kallisto是一种高效、消耗内存小的RNA-seq分析软件,具体原理可见https://blog.csdn.net/qq_35610231/article/details...
进入正题前先了解几个RNA-seq的相关概念:effective length,有效长度:在比对基因组末端的一小部分序列会产生比中间序列更少的reads数,而由于转录本存在内...
SAM,全称Sequence Alignment/Map Format,由header和alignment两部分组成 Header section 解释 header sec...
首先查看samtools view的帮助,发现可以选择比对区域Usage: samtools view [options] | | [region ...] 查看samt...