本文应该是第二全的WGCNA分析教程,参考了最新的文档。第一全的还在路上,会出现于生信宝典和宏基因组公众号组织的二代三代转录组测序分析实战班上,欢迎点击链接了解更多。 WGC...
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分享这个python脚本的原因是:在做GSEA分析时,发现KEGG官网上有些基因集没有出现在c2.cp.kegg.v7.0.symbols.gmt文件中。(c2.cp.keg...
受人之托,所以又跑到另外一个领域去了,中文的资料还不是很全,所以还是自己动手吧 可变剪切工具大全 HussainAther/awesome-alternative-splic...
最近新发现一个工具——parallel-fastq-dump,能多线程运行fastq-dump处理SRA文件,而且与另一个常用的多线程工具fasterq-dump相比,还有-...
文章来源于微信公众号(茗创科技),欢迎有兴趣的朋友搜索关注。 Nilearn简介 Nilearn使许多先进的机器学习、模式识别和多元统计技术在神经成像数据上的应用变得很容易,...
主成分分析,不只需要找到几个虚拟但不知具体为何物的主成分因子,还需要知道我们提供的变量在各个主成分因子上的载荷(有正有负)和贡献度,以及具体保留多少个主成分因子才能既尽量保留...
不平衡数据集指的是数据集各个类别的样本数目相差巨大,例如2000的人群中,某疾病的发生只有100 (5%)人,那么疾病发生与不发生为 1:19。这种情况下的数据称为不平衡数据...
今天来给大家介绍三个我在学习 Python 路上帮助比较大的堪称神级的网站,尤其是对于刚刚入门的同学来说,绝对不容错过~ pythontutor 这个网站对于新手同学理解代码...
昨天老师发给我一篇生信女神Shirley Liu的文章,看了里面的内容之后感觉很兴奋~它可以不做免疫组测序,直接从Bulk RNA-seq或者scRNA-seq里面重构得到免...
日常瞎掰 寒冬渐然远去,疫情似乎也感受到了春天的到来,想与人们一起欣赏这万物复苏的景象。可惜,并不是人们热情不好客,而是仍然处在惊恐中并未找到最好的途径与新冠和谐相处。所...
日常瞎掰 RNA-seq最常用来研究两种condition下有哪些基因的表达值发生了改变,即差异表达基因(different expression gene),从而找到影...
https://github.com/dzhang32/ggtranscript[https://github.com/dzhang32/ggtranscript]