来匹兹堡生活将近两个月了，快要离开之时才开始写博客。因为我知道再不写就不会写了，而这段时间的记忆也会慢慢变得模糊。 下面主要针对我在匹兹堡暑期交流的生活经历，写一写在匹兹堡暑...
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cfDNA fragmentomics分析：多维片段组学方法对CRC晚期腺癌和腺瘤的早期检测文献主要内容 以往基于液体活检早期检测进展期结直肠腺瘤(advCRA)或腺癌(CRC)的研究受到灵敏度低的限制。本文进行了一项前瞻性研究，利用cfDNA的片段组学谱（frag...
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WGBS vs RRBSHow does bisulfite sequencing (WGBS/RRBS) work? DNA甲基化分析是NGS技术中越来越广泛的一项应用。原因很简单:DNA甲基化是...
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R语言_ifelse()函数用法
ifelse()函数 ifelse returns a value with the same shape as test which is filled with elem...
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DNA甲基化数据分析全流程
2021-01-01 更新 简单记录一下平时的分析过程 和RNA-seq前期流程类似 -- 质控、去接头、比对参考基因组、排序 后期就是要提取甲基化位点，包括CpG、CHG、...
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使用DESeq2标准化之后的数据进行PCA、聚类等可视化
DESeq2进行数据标准化的命令有多种 counts(dds, normalized=T) rlog、VST 两者的区别在于 前者 are “only” library-si...
