发简信
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2025-09-19
安装PopLDdecay时报错1.使用conda 安装 但是这么安装的时候~/miniconda3/envs/PopLDdecay/bin路径下...
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VCF文件的一些处理方法
根据vcf文件提取样本名 使用bcftools concat 合并相同样本不同染色体的vcf 检查：
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基因家族分析以MYB为例 从pfam网站下载Myb_DNA-binding.hmm 验证提取到的MYB蛋白是否都具有MYB的结构域1.可以使用网站 Inte...
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Linux中安装R包pophelper
R包版本首先使用conda下载devtools 进入R并使用devtools下载pophelper 如图 成功安装pophelper包 还不成功...
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关于call SNP无变异位点的解决方法
本次使用bcftools call SNP 按以上流程跑完后，vcf文件没有call 出任何SNP。 bcftools mpileup 中添加 ...
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安装基因组组装软件DipAsm
DipAsm[https://github.com/shilpagarg/DipAsm] 是一个利用HiFi数据和Hi-C数据，不需要亲本信息而...
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bcftools根据样品拆分vcf文件文件1：需要提出的样品的id，文件名DB_sample.list 文件2：含有不同样本的变异位点的vcf文件 利用bcftools提取DB_sa...
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使用Aspera，wget和 prefetch下载SRA数据下载Accession list 进入NCBI——进入SRA数据库——输入物种拉丁名——选择Send to中的RunSelector——Go 点...