作者，追风少年i 周三了，好好学习，天天搬砖，人生没有倒带，前进才是真理 接上一篇，10X单细胞（10X空间转录组）通讯分析之总结Nichenet生态位通讯比较分析[http...
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10X单细胞（10X空间转录组）通讯分析之总结Nichenet多条件差异通讯 -
10X单细胞（10X空间转录组）空间相关性分析和cellphoneDB与NicheNet联合进行细胞通讯分析
hello，大家好，随着10X单细胞、10X空间转录组如火如荼的进行中，我们的分析内容和手段也要进入深水区了，很多深入和细节的分析需要我们格外注意了，今天我们来分享两个非常好...
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单细胞之富集分析-1：单细胞GSEA分析流程单细胞GSEA分析需要的文件有两个：1. 单细胞基因表达变化数据（两列，一列是geneid/gene symbol，一列是logFC）（文件格式：.rnk）2. 目标基因集（...
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单细胞测序（sc-RNA seq）分析：Seurat4.0系列教程、高级分析、文章复现
时代的洪流奔涌而至，单细胞技术也从旧时王谢堂前燕，飞入寻常百姓家。雪崩的时候，没有一片雪花是无辜的，你我也从素不相识，到被一起卷入单细胞天地。R语言和Seurat已以势如破竹...
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宝藏R包：TCGA的转录组数据挖掘一站搞定
最近在看ceRNA的时候看到了一个宝藏R包，写包简化了芯片数据下游分析之后，我正想着写转录组下游分析的简化版，就看到了它。用起来~ 0.R包和数据准备 这里使用的是作者给的示...
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RNAseq分析（5）：差异分析工具 GDCRNATools 安装及测试前言 GDCRNATools 是一个用于下载、整理和综合分析GDC中IncRNA、mRNA和miRNA数据的R/Bioconductor包。主要功能包括：差异基因分析、生存分...
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ce-RNA研究套路-如何印paper参考学习资料：https://academic.oup.com/bioinformatics/article/34/14/2515/4917355之前看了技能树的系列推文和曾...
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两个检验给ceRNA锦上添花前面提到过gdcRNAtools里面的ceRNA网络构建 构建鉴定ceRNA的标准有4个：（1）lncRNA和mRNA之间共享的miRNA数量；（2）lncRNA与mRNA的...
