蛋白受体选择 UniProt数据库: https://www.uniprot.org/[https://www.uniprot.org/] 这里以CEACAM6为例 优先选择...
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01小分子-蛋白分子对接 -
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分子对接-openbabel介绍openbabel 官网主页：http://openbabel.org/wiki/Main_Page 介绍： 虚拟筛选离不开分子对接，分子对接离不开分子文件，分子文件的处理离...
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【分子对接】AutoDockDocking算法需要每个原子带有电荷并且需要标记原子的属性。这些信息通常未包含在PDB文件中。我们需要在对蛋白和小分子的PDB文件预处理，生成PDBQT文件同时包含以上信息...
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分子模拟第二弹——基于AutoDock方式实现的分子对接所谓的分子对接，其实就是两个或多个分子之间通过几何匹配和能量匹配而相互识别的过程，通俗来说就是在酶激活剂、酶抑制剂与酶相互作用以及药物分子产生药理反应的过程中，配体（...
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vina分子对接 小分子配体初步准备上节讲到如何从PDB网站下载需要的蛋白，对其和原位配体进行准备之后；下一步就是准备你所需要和蛋白对接的小分子化合物，该步骤方式有很多，这里介绍一种简单快速的方法，适合较多小分...
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分子对接2：Autodock Vina进行分子对接总目录 分子对接1：PyMOL进行可视化[https://www.jianshu.com/p/18b4d56dc516]分子对接2：Autodock Vina进行分子对接[h...
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理解autodock分子对接思路和流程
总结 准备工作： 设置工作目录，用pymol去除水分子，分离蛋白和小分子，得到各自的pdb文件。 （如果是预测得到的蛋白pdb，那就直接拿来用咯，如果是已知结构可从pdb数据...
