参考文献：Confronting false discoveries in single-cell differential expression[https://doi.o...
发简信
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一个R包搞定22种单细胞基因差异分析 -
单细胞之轨迹分析-2：monocle2 原理解读+实操轨迹分析系列： 单细胞之轨迹分析-1：RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析（Pseudot...
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Seurat 基础知识
（一）Seurat的数据结构 版本：3.1.5 直接输入Seurat object的名称，我们可以得到类似如下内容： An object of class Seurat 13...
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我的生信自学心得分享
这是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 从2016年，我开始自学生物信息，那个时候，为了加深自己学习，所以就不间断的在网上分享我的学习笔记。 我有一个自己的博客，xu...
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RNA-seq(7): DEseq2筛选差异表达基因并注释(bioMart)============================================写在前面：可以参考另外一篇《得到差异基因后怎么做？[https://www.jians...
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溶酶体和线粒体共存的所思所得几年前，基于蛋白组数据，苦思冥想后提出一个可能的理论： 溶酶体和线粒体可以融合共存。也就是内体溶酶体和自噬体融合后，并未发生传统的线粒体完全被消化，而是像十几亿年前的原真核细...
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不好好作图的NCS系列(四)：跟着Cell学习与众不同的火山图
这次我们还是继续重复下面这篇Cell文章中的散点图（火山图），这次采用R语言来实现。同时，这里面包含一些画图的知识点！ 读入差异基因分析的文件，并加载ggplot2。 文件中...
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转录组不求人系列(十二): Cell文章最喜欢用的差异基因GO、KEGG富集分析工具
对于转录组分析，差异基因筛选完成后，就算是成功一大半了。接下来就可进行下游分析了。首先最常见的就是对上下调基因的富集分析了，富集分析我们之前出过一期R语言版本的： clust...
