@孟祥霄 应该是R包和R版本的原因。如果你用4.1.0版本的R,那这个R包就不会报错
structure绘图(Rscript)pophelper(R 包) Usage:Rscript ../../script/draw_admixture.R order admixture.fam root_tes...
@孟祥霄 应该是R包和R版本的原因。如果你用4.1.0版本的R,那这个R包就不会报错
structure绘图(Rscript)pophelper(R 包) Usage:Rscript ../../script/draw_admixture.R order admixture.fam root_tes...
脚本 首先导入需要用到的包。--order和-n都是用于指定顺序的,有一个参数就可以了。其他都是必选参数。 核心的排序函数和绘图函数 读入数据,调颜色 画图 中间上色的部分和...
像是输入文件的问题。你再检查一下输入
structure绘图(Rscript)pophelper(R 包) Usage:Rscript ../../script/draw_admixture.R order admixture.fam root_tes...
基本概念 基因渗入(introgression): 是在遗传学中,指两个基因库间的基因流动,通常是经过种间杂交产生。基因渗入是一个长期的过程,它可能需要许多代杂交才能产生回交...
现在已知这个片段在3号染色体上,基本思路是先将vcf文件变成fa文件,然后用blastn处理。 第四列记录的是INS的序列内容 在实际操作过程中竟然出现了重复三次,并且在vc...
筛取vcf中的样品 samplelist_vcf.txt中按列排样本名即可 重命名,再转为bed文件 rename_snp.txt是一个两列文件,分别是旧ID和新ID 筛取b...
15-1 定义一个新的名为Circle的类表示圆形,它的属性有center和radius,其中center是一个Point对象,而radius是一个数。实例化一个Circle...
@小鹿不吃香菜 可能这个名字叫sub的其实已经是ccs了
把HiFi reads变成转录本文件这一次是主线任务,不过要简单许多。官方帮助:IsoSeq/isoseq-clustering.md at master · PacificBiosciences/IsoSeq...
不愧是徐州更老师
说说R语言的转置在群里看到了一个问题,他用R语言的转置函数t()对下面形式的数据进行了转置 转置之后的数据结构如下 他发现转置之后多了一行,也就是有了geneid这一行,和他预期的不符合。按...
@今天能毕业了吗 看看reads数量,然后问问你导师是不是不符合这个物种的规律
把HiFi reads变成转录本文件这一次是主线任务,不过要简单许多。官方帮助:IsoSeq/isoseq-clustering.md at master · PacificBiosciences/IsoSeq...
余大神的力作之一:Guangchuang Yu (https://yulab-smu.top[https://yulab-smu.top/])。绘制出的进化树还是很专业美观的...
输入文件为exmma的输出ps文件,整理为ps2文件,格式如下 调用命令为
两年前会,现在不知道了
pasa安装记录和ORF提取官方文档:https://github.com/PASApipeline/PASApipeline/wiki/Pasa_installation_instructions 之...
@sky_info R绘图我现在也只有草图,没有做得很精细。等以后调整好了会择机发出来的。
二代群体遗传与重测序(中)二.变异结果注释与统计 书接上回https://www.jianshu.com/p/ab6a35502786[https://www.jianshu.com/p/ab6a35...
sort:用于将文本文件内容加以排序 uniq:删除文件中重复的行,得到文件中唯一的行 交集 (用sort将a.txt b.txt文件进行排序,uniq使得两个文件中的行唯一...
先准备文件路径 有些代码是可有可无的,忘了删了