介绍如何使用SNP数据进行GWAS分析,软件选择为emmax和tassel。 软件选择 emmaxplinkqqmanCMplot 数据准备 v...
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mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS)作用:通过对多个表型相似的GWAS summary结果进行联合分析,发现更...
官方网站:https://itol.embl.de/[https://itol.embl.de/] ITOL是Interaction Tree ...
在上一步确定好候选区间后,需要找到候选区间内的基因,即候选区间和参考基因组取交集,用到的工具是bedtools。 关于bedtools的详细用法...
LDSC:连锁不平衡回归分析 - 云+社区 - 腾讯云 (tencent.com)[https://cloud.tencent.com/deve...
(15条消息) GWAS分析中SNP解释百分比PVE | 第四篇,MLM模型中如何手动计算PVE?_邓飞----育种数据分析之放飞自我-CSDN...
目前针对QTL分析有很多软件,比如Plink、 Merlin、R/qtl、FastMap等等,今天给大家分享一下如何使用Matrix eQTL进...
NC文章的全基因组部分,关于GWAS的一些图本来不想复现,但是看到近期很多文章包括单细胞总是会挖掘GWAS用于自己的研究,而小编负责的课题也涉及...
主要参考自:Hail | GWAS Tutorial[https://hail.is/docs/0.2/tutorials/01-genome-...
系统学习下BOLT-LMM的软件手册, 1 概述 BOLT-LMM软件包目前由两种主要算法组成,即用于混合模型关联分析的BOLT-LMM算法和用...
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