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使用ggplot画出带圆圈的tsne聚类图 -
在热图中标注出特定基因的名称对于基因的差异表达谱，常用热图作为展示。但有时差异基因可能非常的多，热图中不可能将所有基因的名称标注出来。那么此时不妨选择一些比较重要的基因（比...
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R绘图(1): 在散点图边缘加上直方图/密度图/箱型图当我们在绘制散点图的时候，可能会遇到点特别多的情况，这时点与点之间过度重合，影响我们对图的认知。为了更好地反映特征，我们可以加上点的密度信息，比...
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明明就是整数啊你怎么说不是呢！
1.问题 今天学员用counts表达矩阵去做差异分析，被Deseq2报错说不是整数，如图： 明明就是一个看起来挺正常的counts矩阵！然而： ...
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删除特定数值重复的列
给一个小朋友写的脚本原dataframe： 需求：删除数据框中6重复的列，脚本如下 不知道有没有简单的函数可以代替。
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从10X单细胞bam文件中提取某一个细胞类型的bam
我们之前简单做了一下cellranger的上游分析单细胞上游软件cellranger从头说[https://www.jianshu.com/p/...
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【基因组学】提取基因的启动子序列
写在前面 通常我们碰到的是，根据gff文件提取cDNA序列，这个比较容易满足，但是有时候我们需要构建native promoter 载体的时候，...
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一行命令完成RNAseq数据标记重要基因
前面介绍了怎么一行命令完成RNAseq差异分析加作图，那如果我们已经有自己重点关注的基因，并且想把这些基因在差异结果里展示出来怎么弄呢？ 今天再...
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可以从fasta中提取基因序列的4款软件
前言 做生分析有时候需要从基因组fasta文件中提取基因的序列，对于这个需求有不少现成的软件可以来实现，今天来跟大家分享4款可以完成这个需求...
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