今天时间不够，只是简单地按照教程完成了基本的mini conda的安装，并使用miniconda安装fastqc
conda
相当于app store，可安装各类生信软件
miniconda 下载、安装与激活
- 百度到清华镜像网站，根据服务器位数复制相应的linux版本链接到biosoft目录下，通过搜索得到链接为：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
- wget+链接，即可下载
- 安装：
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh,根据过程中的提示按Enter或输入yes - 激活：
source ~/.bashrc - 验证：
conda输入后应有满屏信息
添加镜像
此段代码明日应回顾,并补充理解
# 使用中科大的镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
conda安装软件
- 查看当前服务器上安装的所有软件列表
conda list - 安装软件
conda install fastqc -y#-y即自动说yes，在fastqc后可用=0.11.7指定版本号 - 确认fastqc软件是否安装成功
fastqc --help
会出现帮助文档 - 卸载软件
conda remove fastqc -y
思维导图
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