一、将miniconda下载到服务器上

1.打开Xshell，创建biosoft目录（mkdir），打开目录（cd），输入命令 uname -a查看服务器位数
2.输入（wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda-1.6.0-Linux-x86_64.sh）
3.输入（bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh）根据命令输入enter yes

成功界面

微信图片_20230111205043.png

4.输入source ~/.bashrc激活conda
5.输入conda，出现信息就成功了

界面2.png

6.添加镜像
输入（# 使用中科大的镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes）

二、使用conda下载软件

1.conda list 查看服务器的软件目录列表
2.conda install fastqc -y 下载名字叫fastqc的一个软件
3.fastqc --help 出面大片文字界面就是下载成功了
4.conda remove fastqc -y 卸载软件