宋真宗的第三项改革措施是实行别头试、锁厅试。 别头试又称“别试”，起于唐代，是特为知举官及与科举考试有关人员之子弟、亲属专门举办的考试，以防考官徇私舞弊。但当时并未固定的形成制度。自宋太宗雍熙二年（985 年） 省试令考官亲戚别试以后，宋代的别头试才逐渐固定下来。不仅与试官有亲嫌者为避亲专设考场外，宋代别试的对象还不断扩大，规定凡是省试主考官、 州郡发解官和地方长官的子弟、 亲戚甚至门客等， 在应省试和发解试时， 都要另派考官，别坐就试。
宋真宗咸平元年（998） 还规定国子监、开封府的发解官亲戚也需别试。到宋仁宗景祐四年（1037），又规定诸路亦实行别头试。至此，宋代“惟临轩亲试，谓之天子门生， 虽父兄为考官， 亦不避”（《宋史》 卷 156《选举志》） 外， 所有科举考试都实行别头试制度。 别头试的普遍实行， 有助于裁抑子弟， 奖进寒士。
另外， 在宋代， 现任官员也可以参加科举考试， 这更是一个极易产生考试腐败的考生群体， 他们活动能量大， 善于投机钻营， 关系盘根错节， 所以，北宋王朝对他们的应举实行专门的“锁厅试”。 规定凡参加省试的现任官员，必须由所在长吏， “先考试艺业，合格者始听取解。如至礼部不及格，当停现任。其前后考试官、举送长吏，皆重置罪。”（《文献通考》 卷30《选举考》 3） 真宗天禧三年（1019） 进一步规定，凡锁厅试不合格者， 定为私罪， 罚铜 10 斤， 并永远不准再应举。 现任官员的考试必须另设场屋， 即使殿试第一名， 也要降为第二名，“锁厅人不为状元” 是当时一条不成文的规定。 此规定在仁宗天圣之后才逐步放宽限制。
真宗还于景德四年命令大臣详定《考校进士程式》， 送礼部贡院， 规定举子必须还原籍应举， 各州解送举人应保证考察其德行， 如已解送而有德行缺失， 则处罚州县相关官吏； 若省试而文理荒谬， 则要处罚地方考官。 此外， 还在景德五年规定贡举人曾参加过省试者， 如犯公罪则允许以赎代罚。
