努力努力再努力~<br>个人博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Flishensuo.github.io%2F" target="_blank">https://lishensuo.github.io/</a>
IP属地：浙江
-
复现3：AD外周血的单细胞转录组与免疫组库分析Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Reveals Immune Cell Signatures in Alzhei...
-
10X单细胞（10X空间转录组）之一张UMAP图同时展示两个基因的表达情况还记得之前一直有同学问，如何在一张图上同时展示两个基因的表达情况，方便比较，今天我们来实现一下 这里我随便挑选了两个基因，但是大家在做分析的时候，这两个基因最好是细胞通讯得到...
-
-
monocle实操+细胞功能富集分析monocle实操 1 软件安装 1.1 conda安装——Linux https://anaconda.org/bioconda/bioconductor-monocle[...
-
免疫组库数据分析1-scRepertoire免疫组库基础知识见：单细胞免疫组库：TCR基因重排原理和TCR测序建库方法[https://www.jianshu.com/p/c4896ffadc46] scReperto...
-
单细胞转录调控网络分析工具（TF，motifs）-SCENIC相信很多专题应该已经讲过SCENIC的使用，这儿，针对我自己对SCENIC的学习使用，遇到的问题做一个详细的讲解说明，希望能对大家理解学习应用SCENIC起到一些帮助。 SC...
-
10X单细胞转录组多物种联合分析：以人和小鼠为例10X单细胞转录组是可以联合分析多个物种的。也许，你会问为什么要分析多个物种，我一个物种的某个器官还整明白呢？其实在做： 模型 移植 免疫 病毒 生殖隔离 的时候，同一个组织...
-
定量免疫浸润在单细胞研究中的应用最近听说定量免疫浸润很火，于是我也报名参加了果子老师的课程，跑了几个R包，你比如说xCell啊，GSVA啊，MCPcounter啊，ConsensusTME，ImmuneSu...
-
CellChat：细胞间相互作用分析利器前言 我们知道，细胞间信息传递方式一个是细胞表面配受体的相互作用，另一个通过细胞产生的可溶性小分子，即细胞因子。在单细胞数据分析中下游，有时候我们想看某几种细胞类型之间的相互...
-
单细胞分析实录(7): 差异表达分析/细胞类型注释
前面已经讲解了：单细胞分析实录(1): 认识Cell Hashing[https://www.jianshu.com/p/02b70bda5d0a]单细胞分析实录(2): 使...
-
-
CellPhoneDB：细胞受体配体互作分析工具最近在学习cellphoneDB，顺便写一个学习记录吧。 简介 CellPhoneDB是一个可公开获取的受体、配体及其相互作用的存储库。配体和受体都包含亚基结构，准确表征异质...
