你不得不知道的GEO数据库芯片数据分析方法 大家好,我是阿琛。今天来给大家介绍一个新的专题内容---GEO数据库的使用方法。烹饪需要食材,分析需要数据。数据出发,整个研究的第...
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hello,大家好,今天我们来实现一下下面的这张热图 我们最关注的就是图的右边只标记感兴趣的基因,如何实现呢??? 准备作图文件 接下来,让我们来实现一下上面的热图。 为了绘...
时间序列分析:对不同时间点(状态)转录组或蛋白表达谱数据,进行模糊c均值聚类(fuzzy c-means clustering, FCM),找出具有相似表达模式的基因或蛋白并...
前言 在绘图时,如何搭配颜色,是一个很让人头疼的问题。今天要介绍的包 ggsci 能大大减轻我们的负担。 ggsci 提供了很多高质量的颜色搭配,其灵感来自于各种 SCI 杂...
继上次跟大家分享了云雨图和分组直方图之后,今天再跟大家介绍一种适用于统计描述的高颜值图——环状直方图和散点图。它其实是将分组直方图跟分组散点图组合在一起的图。接下来我们开始学...
说起互作网络图,大家都不陌生。看文献的时候,经常看见相互作用网络图展示了circRNA-miRNA的靶向关系或者ceRNA竞争性网络关系。我们先来看几个图: CircRNA-...
1.安装 载入WGCNA包时会发现部分包没有安装需要手动安装 打开多线程 2.导入数据 2.1 矩阵转置 2.2 查看 3 检查离群样本 4 选择合适的软阈值 sft为一个列...
R 数据可视化 —— 聚类热图 ComplexHeatmap(四)图例 前言 忘了说了,直接使用 安装的版本比较老旧,有些功能不支持。比如富文本解析函数 gt_render,...
无意中发现一篇纯生信文章,虽然发表在神刊Medcine,但还是有一定参考价值的。 PMID: 33879726[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pm...
PCA(Principal Component Analysis)主成分分析, 用来考察多个变量间相关性一种多元统计方法,研究如何通过少数几个主成分来揭示多个变量间的内部结构...
1. 简介 PCA(Principal Components Analysis)即主成分分析,也称主分量分析或主成分回归分析法,是一种无监督的数据降维方法。首先利用线性变换,...
跟着Cell学作图|8.富集网络图(Cytoscape/ClueGO) “实践是检验真理的唯一标准。”“复现是学习R语言的最好办法。” DOI: 10.1016/j.cell...