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写在前面 前段时间，推过两个教程，分别是：1.《零基础快速完成基因功能注释 / GO / KEGG / PFAM...》2.《「GO富集分析」从原理到实践 ~ 零基础掌握》 ...

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2023年3月10日，来自波多黎各大学Van Belleghem等多团队合作在国际顶级期刊《Science》上在线发表了题为“High level of novelty un...

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作者：云歌审稿：童蒙编辑：angelica 和小伙伴们简单聊聊三代测序的应用和PB测序平台5mC检测方向，作为回归的热身~ 一、三代测序平台应用概览 近几年，以PacBio和...

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转录组测序的最直接目的，就是设法寻找组间显著表达变化的基因，解释基因表达水平的变化对生物功能的影响。例如，肿瘤患者与正常人群相比哪些编码蛋白或非编码RNA分子发生了失调，这些...

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序 言   生信分析真的是跑下别人的软件就ok了么？很明显这样认为有些肤浅。先不说软件好不好用的事，即使勉强能够正常运行得到结果就万事大吉了么？这里也不讨论数据好坏的问题，得...

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背景 经常在HiC文章中看到TAD边界强度变化图，大体上可以反映TAD之间隔绝情况,绝缘系数越低，TAD之间交互越弱。如下图： 画图的方法： 有点类似ChIP-seq pe...

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作者：Jenny审稿：童蒙排版：amethyst 引言 在表观多组学联合分析中，我们经常会遇到想对某个区域可视化，每当看到高分文章里漂亮的tracks图，就羡慕不已。今天小编...

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转自：https://www.sohu.com/a/220053461_761120[https://www.sohu.com/a/220053461_761120] 写在前...

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写在前面 半个月前，我推了一个《任何人都能掌握-基因家族分析》的腾讯课程（原本事实是开给课题组）。在热身课程（完全免费）中，将我个人对基因家族分析的认知和其意义均做了说明，感...

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写在前面，得到HiC-pro的结果后，我们想看看显著的互作区域以及两个样本互作区域的不同. 关注正常染色体 比较不同实验组数据大小，如果相差比较大，利用shuf随机提取等量数...

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github：https://github.com/eldariont/svim-asm[https://github.com/eldariont/svim-asm] ref...

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安装官网中提到三种安装方法，可通过conda, pip，git clone 安装该软件.我们这里利用conda,非常简单快速.1.1 conda创建环境 1.2 conda ...

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hic数据经过Hic-pro处理后，会生成allvalidpairs文件，这是所有有效配对的文件。一般想要可视化的话，比较复杂。这时我们就可以把它转化为.hic文件，放到ju...