杨_younger

一.conda安装multiqc软件 1.安装conda 2.安装python2环境 3.用conda安装multiqc软件 4.查看multiqc是否安装成功 multiq...

杨_younger

该教程分为2部分，第2部分在：miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw reads，鉴定已知miRNA-预测新miRNA，到表达矩阵【二】 因为之前碰到...

杨_younger

转录组分析总体流程如图所示，主要分为上游分析（原始数据质量控制、比对、组装、定量），下游分析（差异分析、富集分析）和高级分析（共表达分析、GSEA、时序性分析等）。整个流程图...

杨_younger

主成分分析(PCA)及其可视化的基础指南 后台很多同学私信想学习一下主成分分析(PCA),今天就简单写一下。之后有看到文章再实战复现。 主成分分析（PCA）是一种将数据降维技...

杨_younger

导读 主成分分析(Principal Components Analysis，PCA)，也称主分量分析或主成分回归分析法，是一种无监督的数据降维方法。PCA通过线性变换将原始...

杨_younger

本期内容为[R语言可视化-精美图形绘制系列]--主成分分析（PCA） 主成分分析：PCA（Principal Component Analysis）是一种常用的数据分析方法。...

杨_younger

R语言的主成分分析（PCA）详解和带聚类的PCA图绘制 最近有个老师在整理文章数据，由于分组较多，想展示PCA图，说明不同分组的差异，公司默认给出的PCA图比较朴素，想做的好...

杨_younger

原文链接：两组或多组GO/KEGG富集结果气泡图绘制(点击链接)[https://mp.weixin.qq.com/s/MDGhpZKvrj9shfS6XtvX9Q] 复现图...

杨_younger

本文是对WGCNA英文说明文档的翻译，英文的请查看这里[https://horvath.genetics.ucla.edu/html/CoexpressionNetwork/...

杨_younger

转录组测序的目的之一，就是探索组间显著表达变化的基因——差异表达基因。那么，如何基于转录组测序获得的定量表达值，识别差异表达变化的基因或其它非编码RNA分子呢？DESeq2是...

杨_younger

第三章 隆线溞不同生殖个体间RNA-seq与miRNA-seq分析 3.1 前言 隆线溞（Daphnia carinata）隶属节肢动物门（Arthropoda）、甲壳纲（C...

杨_younger

前段时间，发表了一篇叶绿体基因组比较分析文章。尽管这类套路文已经不再热门，但在准备数据分析的过程中，仍感各种资料教程之零散，各种文章的做图工具也是令人眼花缭乱。故此，列出个人...

杨_younger

文章仅是记录自己的学习使用，有错误请指出，我立刻改正！ 官方说明：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279684/#appendic...

杨_younger

BLAST采用了一种局部序列比对的算法分析两个序列中的相似区域，并计算统计显著性。主要包括四大类：1. Nucleotide BLASTblastn: 将待查询的核酸序列及其...

杨_younger

LD概念 连锁不平衡(linkage disequilibrium, LD)也叫等位基因关联，是指不同座位的两个等位基因出现在一条染色体上的频率与随机组合出现的频率不一致的情...

杨_younger

Hi，大家好。远程连接的实现方法有很多，概括地说有两种，一种是用系统自带的远程连接，另外一种是用第三方软件进行远程连接。今天分享6款非常好用的Linux远程连接工具，一起来看...

杨_younger

Wang LC, Cui WY, Zhang Z, Tan ZL, Lv QL, Chen SH, Shen XL. Expression, methylation and ...