1、通过KEGGREST包来探索KEGG数据库的12大代谢通路 通过观察KEGG官网 ：https://www.genome.jp/kegg/pathway.html[htt...
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R获取KEGG/GO中某一通路所有基因 -
单细胞谱系分化高级算法2021.02.14今天收集了三个与谱系分化有关的单细胞高级算法：MAGIC（2018 Cell），PHATE（2019 NBT），Palantir（2019 NBT）。它们...
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利用贝叶斯的方法获得cell cluster的marker基因
理论 参考文章为：genesorteR[https://www.biorxiv.org/content/10.1101/676379v2.full]简单理解下，每个cell ...
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利用Seurat包Transfer数据集（FindTransferAnchors和TransferData）2022-6-09关键词 FindTransferAnchors函数 TransferData函数 细胞类型注释 映射数据集/Transfer 数据集 适用背景 细胞注释的标准一直备受争议，就...
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10X单细胞（10X空间转录组）巨噬细胞分析之M1/M2分型讨论
hello,大家好，周三了，一周又要过去了，时间真的是过得飞快，根本来不及反应，真的是一寸光阴一寸金，寸金难买寸光阴~~~ 今天分享一个小的知识点，单细胞关于巨噬细胞分析的常...
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使用ggplot2优化Seurat绘图单细胞绘图系列： Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e834d] Seurat是分析单细胞数据一个非常好用的包，自带...
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Bootstrap 1 介绍Bootstrap 是一种常用的统计手段， 本文主要介绍一下 Boostrap 是什么东西，以及它的优点。 内容参考自油管视频 StatQuest Bootstrap[ht...
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ggplot2如何在多个图像之间使用统一的配色
当使用ggplot2构建多个图片但是需要其中的元素使用统一的配色方案可以参考如下方案进行： 设置一个带有name的向量，之后使用scale_colour_manual(val...
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pheatmap如何更改横纵坐标标签的颜色
pheatmap是一个功能十分强大的R包，在绘制热图方面十分的便利，但是该包没有提供修改热图横纵坐标标签颜色的方法，如果想要更改颜色可以参考如下的策略： 此教程参考： htt...
