基因组的保守性常常与功能有关,保守性强的序列可能在细胞的发育和调控等方面发挥着至关重要的作用。分享一下一般的分析保守型的方法: 首先要下载保守性分值的文件,可以在UCSC中选...
基因组的保守性常常与功能有关,保守性强的序列可能在细胞的发育和调控等方面发挥着至关重要的作用。分享一下一般的分析保守型的方法: 首先要下载保守性分值的文件,可以在UCSC中选...
由于分析需求需要使用PhastCons分析DNA的保守序列,以及使用SIFT软件分析氨基酸变异的有害性,经过一段时间的探索,对这两款软件已经有了还算全面的认识,在此记录一下分...
0.代码来源文章参考:《Large-scale ruminant genome sequencing provides insights into their evoluti...
太厉害啦
跟着Science学保守元件(Conserved Elemtns)的鉴定0.代码来源文章参考:《Large-scale ruminant genome sequencing provides insights into their evoluti...
0.代码来源文章参考:《Large-scale ruminant genome sequencing provides insights into their evoluti...
最简单命令,output是输出文件夹。prokka --outdir output test.fasta
写的不错哦
比较基因组学Cactus初探11.21更新,本文内容包括Cactus进行无参基因组比对的详细教程。 你说的对,但是Cactus是一款开源的,发表过正刊的,高度权威的基因组比对软件.jpg Cactus是...
11.21更新,本文内容包括Cactus进行无参基因组比对的详细教程。 你说的对,但是Cactus是一款开源的,发表过正刊的,高度权威的基因组比对软件.jpg Cactus是...
您好,这个生成的树文件,是XP_011609492这样的命名么?
单拷贝直系同源基因构建物种进化树最近用Orthofinder做物种进化树,最后出来的物种树的结构跟已发表研究的结果差距较大,在我的印象里Orthofinder软件是用单拷贝直系同源基因进行建树的,然后跟老师...
最近用Orthofinder做物种进化树,最后出来的物种树的结构跟已发表研究的结果差距较大,在我的印象里Orthofinder软件是用单拷贝直系同源基因进行建树的,然后跟老师...
您好,PhastCons分析之前,软屏蔽的重复序列有影响么
关于PhastCons和SIFT4G的使用由于分析需求需要使用PhastCons分析DNA的保守序列,以及使用SIFT软件分析氨基酸变异的有害性,经过一段时间的探索,对这两款软件已经有了还算全面的认识,在此记录一下分...
由于分析需求需要使用PhastCons分析DNA的保守序列,以及使用SIFT软件分析氨基酸变异的有害性,经过一段时间的探索,对这两款软件已经有了还算全面的认识,在此记录一下分...