hist 用于绘制直方图,下面介绍每个参数的作用; 1)x: 用于绘制直方图的数据,该参数的值为一个向量 代码示例: data <- c(rep(1, 10), rep(2,...
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请问在服务器上没有root权限要如何安装?谢谢!
LD SCore计算基因多效性、遗传度、遗传相关性(the LD Score regression intercept, heritability and genetic correlation)这篇文章是对之前啊啊救救我,为何我的QQ图那么飘(全基因组关联分析)这篇文章的一个补坑。 LD SCore除了查看显著SNP位点对表型是否为基因多效性外,还额外补充了怎么计算...
@橙子牛奶糖 你好!用PLINK2 总是提示“No entries in pheno.txt correspond to loaded sample IDs”,文件是和plink1.9用的一样的,不知道是什么原因?谢谢!
LD SCore计算基因多效性、遗传度、遗传相关性(the LD Score regression intercept, heritability and genetic correlation)这篇文章是对之前啊啊救救我,为何我的QQ图那么飘(全基因组关联分析)这篇文章的一个补坑。 LD SCore除了查看显著SNP位点对表型是否为基因多效性外,还额外补充了怎么计算...
这篇文章是对之前啊啊救救我,为何我的QQ图那么飘(全基因组关联分析)这篇文章的一个补坑。 LD SCore除了查看显著SNP位点对表型是否为基因多效性外,还额外补充了怎么计算...
简单理解,t检验是两组均值比较的假设检验,P<0.05则表示两组均值存在显著差异。而F检验(一般更常称为方差分析analysis of variance)就是多组均值是否相同...
jimmy布置的个R语言中级作业中提到了几个R包,我查找了Bioconductor中org.Hs.eg.db包的使用说明书,为了自己更好的理解和应用,做了以下笔记。 首先了解...
目前见过的结果解释主要有两种: 1.按照曲线类型解释(针对整体而言) Totalironandnonhemeironintakewasassociatedwithdiabet...
RStudio下载:https://rstudio.com/products/rstudio/download/[https://rstudio.com/products/r...
前言 如何用R语言来快速统计向量中每个元素的个数呢?今天我们来分享两个含量函数分别是table、rle,第一个函数用过R的人应该都了解,第二个rle函数就不常见了,可能很...
一、待解决问题 A文件如下所示。tip:ID列指的是图中带红框的那列,A大小73.1MB、B大小约1GBimage.png B文件是从网上下载的注释文件"GCF_000001...
方法一:Rename函数 Linux下修改文件名有mv和rename。其中mv命令只能对单个文件重命名,这是mv命令和rename命令的在重命名方面的根本区别。 linux的...
在对同一路径下多个文件做相同处理时,可以循环读取文件夹中的文件,批量读取,处理和写入文件,会大大提高工作效率,在R语言中,处理方法如下所示。 1.批量读取文件 2.批量处理文...
1、使用 VMWare 虚拟机,虚拟机启动后,会在虚拟机目录下建立一个与虚拟内存大小相同的 .vmem文件,例如:564db13c-c92d-3d3a-41a0-f62af7...
欢迎来到"bio生物信息"的世界 6天前,BMC Genomics 推了一篇文献“Population history and genetic adaptation of t...
一个SNP周围有很多基因,不知道到底如何确定哪个才是相关基因呢?
PLINK+TASSEL做GWAS+Post-GWAS分析此视频来自B站,是非常好和全的的一个GWAS操作的视频,从开始准备软件下载,数据过滤,到最后的候选基因注释。GWAS的实战视频https://www.bilibili.com...
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R可视化相关性矩阵的几种方案 R中相关性矩阵的可视化解决方法在已经有很多了,我们在这里总结一些常用的都有哪些: ggplot2包 corrplot包 热图包(pheatmap...
理解SNPs之间的联系或连锁不平衡(LD)模式对于单体型的选择具有重要作用,然而,对于密集的SNP图谱,随着区域内SNPs数量的增加,很难直接从复杂的VCF文件来看出SNPs...
要查询以往的 GWAS 研究结果,可以使用 GWAS Catalog。GWAS Catalog 包含的信息非常多,不过有时可能满足不了需要。介绍一个叫 CAUSALdb 的数...