一、安装ECNet （一）虚拟机使用极狐网站 引用链接： https://www.jianshu.com/p/8afdd5b48e56 [https://www.jiansh...
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2022-11-22--期末.2一、下载数据 1. 下载参考基因组 2. 下载SAR数据 因为下载下来的文件并非输入文件格式fasta格式，且此sar数据为双端测序，若不拆分开，则在后续的比对中易出现问题，...
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2022-11-12--期末.1此次实验操作由于参考基因组下载出问题，实验中止，正确操作请参考下一篇。 一、下载数据 1、下载SAR数据 进入NCBIwhole genome sequencing - Bi...
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2022-09-26-----随堂测验下载Synechococcus elongatus UTEX 2973（accession no.为GCA_000817325.1 ）的基因组注释文件,生成一个locus_t...
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2022-10-04---SPADS安装1.spades安装 tar zvxf /disk1/shares/SPAdes-3.12.0-Linux.tar.gz -C ~/Biosofts/ #将压缩包解压到Bio...
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2022-09-20----Fastqc安装运行一、安装java环境 已经安装好了 二、fastqc安装 cd ~/Biosofts #进入目录 wget http://www.bioinformatics.babraha...
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2022-10-10--Quast运行1. Quast安装 2. 分别对Spades和velvet结果进行评价 （1）velvet的拼接 出错 可以找到文件contigs.fa 按q退出文件 再次尝试拼接，失败 ...
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2022-09-19---生物软件及应用-作业1一、下载Synechococcus elongatus UTEX 2973（accession no.为GCA_000817325.1 ）的基因组注释文件，统计其中染色体序列...
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2022-09-13生物软件应用----作业二一、安装aspera软件 打开虚拟机，输入: ssh -p 6000 202031107010217(学号）@47.100.23.66 输入密码：bioinfo20,然后回车...