文章标题：Fast and accurate metagenotyping of the human gut microbiome with GT-Pro[https://w...
发简信
IP属地：湖北
-
meta SNV gt-pro -
meta挖质粒plasflow
文章标题：PlasFlow: predicting plasmid sequences in metagenomic data using genome signatures...
-
meta SV sgvfiner269方法标题：Comprehensive evaluation of structural variation detection algorithms for whole ...
-
@kim_zhu 建议三连一波
在shell脚本中切换conda环境
导读 常用的conda activate切换conda环境的方法只能在命令行中使用，放在脚本中会报错，该如何解决呢？ 一、脚本中使用conda activate 凉凉 二、b...
-
@环境微生物 为什么不打赏一下呢
phylophlan3使用(更新)
下载、安装 软件运行配置文件无需基因组fna或者faa文件基因组是fna，配置文件（下一步速度慢，不推荐） 基因组翻译后的faa（速度更快，推荐使用），配置文件。 参数 -o...
-
-
PHI: pathogen host interactions网址：http://www.phi-base.org/releaseNote.htm[http://www.phi-base.org/releaseNote.htm] 当前版...
-
三代组装metaFlye
github: https://github.com/fenderglass/Flye[https://github.com/fenderglass/Flye] 安装 使用 ...
-
opera-ms META混装
github: https://github.com/CSB5/OPERA-MS[https://github.com/CSB5/OPERA-MS] 文章文章：Hybrid ...
-
mmseq2序列聚类
文章标题：MMseqs2 enables sensitive protein sequence searching for the analysis of massive d...
-
use plink2plink2: https://www.cog-genomics.org/plink/2.0/[https://www.cog-genomics.org/plink/2.0/...
-
plink GWAS [2]
样本质控 --remove 删除样本FID IID--maf minor allele frequency 删除低频--mind Missingness per indivi...
-
meta挖质粒/病毒genomad
文章标题：Identification of mobile genetic elements with geNomad[https://www.nature.com/arti...
-
phylophlan3使用(更新)
下载、安装 软件运行配置文件无需基因组fna或者faa文件基因组是fna，配置文件（下一步速度慢，不推荐） 基因组翻译后的faa（速度更快，推荐使用），配置文件。 参数 -o...
-
kraken2bracken build dbkraken2 github:https://github.com/DerrickWood/kraken2/blob/master/docs/MANUAL.markdown[...
-
nt/nr物种 | megan/Blast2lca
Github:https://github.com/emepyc/Blast2lca[https://github.com/emepyc/Blast2lca]https://...
-
CheckM2终于更新了文章标题：CheckM2: a rapid, scalable and accurate tool for assessing microbial genome qualit...
