参考文献[https://www.nature.com/articles/s41596-018-0103-9]EnrichmentMap分析有助于研究人员获得从基因组规模产生...
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单细胞差异基因EnrichmentMap使用教程 -
UMAP图上同时展示多个marker基因
最近有小伙伴问道一个问题，如何在一个单细胞UMAP/TSNE图上展示多个marker基因的表达，乍一看挺简单的，后来也是思考了一些时间，慢慢解决了这个问题。 首先，Seura...
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seurat V5升级：一些常见报错1、数据在不同环境中的兼容情况 目前V5版本的环境可以兼容V3版本的数据，但是V3环境中导入V5环境会报错（缺依赖包）。目前有两种方式新建R对象数据CreateSeuratO...
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Velocyto: 提取剪接矩阵官网：http://velocyto.org/velocyto.py/tutorial/cli.html[http://velocyto.org/velocyto.py/tu...
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热图去掉聚类树但是保留聚类
看到这个问题，你可能搜了好多答案，比如 热图如何去掉聚类树的同时保留聚类的顺序？ - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/e...
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R语言 ggplot2 中为分面添加不同注释R语言中分面是一个很好用的功能，尤其是在处理多组数据时。可以很好地将图分割成多个分面，展现数据的子集特征。 比如说： ggplot(mpg, aes(x=displ, y=c...
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scATAC-ArchR软件如何更准确定义特定细胞群/celltype的组间差异peaks？
最近在做某类细胞亚群细分时特定群的组间差异peaks时，发现了以下几个方面的问题：以下是参考脚本getMarkerFeatures[https://www.archrproj...
