作者，Evil Genius hello，好久不见，最近一直在忙空间转录组培训班的事情，简书更新较少，大家感兴趣可以去B站看看上课的视频，希望对大家有所帮助。 今天我们需要分...
发简信
IP属地：广东
-
空间转录组数据分析之生态位聚类（Banksy） -
cellphoneDB呕心沥血下载安装教程
我安装了一天之后快哭了，然后去100块买了个老师指导生信自学要么哭要么花钱，就是我这个垃圾1、安装https://github.com/ventolab/CellphoneD...
-
illumina beadchip 芯片原始数据处理需求 和这一篇的需求一致，不同公司的芯片原始数据处理方式也不同，最终都是为了得到表达矩阵，今天介绍的是illumina beadchip 芯片，用神奇的limma搞定它。找不...
-
如何实现GSEA-基因富集分析？基因富集分析（Gene Set Enrichment Analysis，GSEA）是一种针对全基因组表达谱芯片数据的分析方法，将基因与预定义的基因集进行比较。即综合现有的对基...
-
-
Cytoscape绘制相关网络图导读 用R软件corr.test函数进行两组数组的相关性分析，用Cytoscape绘制相关网络图。 一、输入数据 代谢数据：metabo.txt 16S数据：genus.tx...
-
TCGA文章复现——LncRNA-CRC预后Title:An Integrated Three-Long Non-coding RNA Signature Predicts Prognosis in Colorecta...
-
Linux安装R包TwoSampleMR遇见的报错
最近一位老友在倒腾GWAS的研究，发现R包TwoSampleMR用于pQTL的分析，让我在Linux系统上帮忙安装下，根据网页的安装提示进行操作（https://g...
-
#circRNA从入门到精通#circRNA从入门到精通[https://mp.weixin.qq.com/mp/appmsgalbum?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&action=ge...
-
SNP数据构建系统进化树大概是长期的不锻炼使得今天的爬山运动过量了，接着悲剧就是无法入眠。也幸亏明天是周日，干脆就起床码字了。总结下自己前面用snp构建系统进化树的方法吧。 1.构建进化树的算法 构...
-
snp数据构建NJtree（phylip软件）参考链接 SNP数据构建系统进化树 - 简书[https://www.jianshu.com/p/57599b6a71e8]https://www.jianshu.com/p...
-
miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw reads，鉴定已知miRNA-预测新miRNA，到表达矩阵【一】该教程分为2部分，第2部分在：miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw reads，鉴定已知miRNA-预测新miRNA，到表达矩阵【二】 因为之前碰到...
-
方便快捷的smallRNA数据分析流程前言 今天来跟大家分享一个smallRNA的分析流程——sRNAnalyzer[http://srnanalyzer.systemsbiology.net/]。这个流程是...
-
ggplot2之颜色设置
该文章为个人为了复习总结的笔记，参考来源为： https://www.sohu.com/a/348752646_785442 https://www.jianshu.com/...
-
MutSigCV进行突变负荷分析寻找Driver Gene
本文的安装方法是有Matlab授权，运行MutSig源代码的方法。 如果没有Matlab授权，可以 http://www.mathworks.com/products/com...
-
10X单细胞（10X空间转录组）降维分析之UMAPhello，大家好，关于降维算法，在之前分享的文章10X单细胞（10X空间转录组）降维分析之tSNE（算法基础知识）[https://www.jianshu.com/p/0f...
-
CellChat三部曲1：使用CellChat对单个数据集进行细胞间通讯分析CellChat三部曲1：使用CellChat对单个数据集进行细胞间通讯分析 自从周运来在简书写了一篇cellchat的中文介绍教程，然后R包作者也在B站做了直播介绍，cel...
-
简单介绍IGV软件的安装和使用
最近遇到了一个售后，客户在使用IGV时遇到问题，我之前也没有用过此软件。现在便把安装过程记录一下。 IGV（The Integrative Genomics Viewer）这...
