最近在看论文 Phased diploid genome assemblies and pan-genomes provide insights into the genet...

最近在看论文 Phased diploid genome assemblies and pan-genomes provide insights into the genet...
注:本文完全引用自http://www.360doc.com/content/17/0114/16/35684706_622440037.shtml,仅用作个人学习,如有侵权...
在跟着健明老师学习生物信息学的过程中,少走了很多弯路,躲过了很多坑,在指导下浅尝过一些。但是自己常常扣原理,又双叒叕落坑,百思不得其解。以下是之前遇到的问题,今天整理带大...
最近有个任务需要从基因组中提取所有的内含子(intron)区域。一开始觉得很简单,用ensembl上的biomart或者ucsc genome browser一顿猛点应该就可...
之前有一次,我导说“能不能把这些基因按顺序画在果蝇的染色体上”,因此,我寻找了一些实现这个需求的方法。经过一番奇奇怪怪的操作之后,最终用ggplot2画了。。。其它方法简单地...
ChIP-seq、ATAC-seq等获取到基因组范围内的peak后,需要对其进行基因注释以便进行后续的分析。ChIPseeker做为peak注释的R包,用来很不错,但有时...
今天分享的学习笔记是一套转录组分析简单流程,适用于初学者入门阅读,从原始测序数据开始,经过质控、序列比对、定量表达、差异表达、功能富集等一系列分析步骤,最终获得基因表达信息。...
关于基因组组装的流程可以参考我的简书:https://www.jianshu.com/p/e02ecd537c83 前面介绍了SOAPdenovo2的使用,但是由于结果整体不...
同求封装代码,感谢!
群体结构分析软件Structure了解和使用一、简介 Structure 是一个利用遗传标记推断群体遗传结构的软件。其功能包括推断群体数目,判断某个个体属于哪个群体,鉴别迁移个体及杂合体等。举个例子 上图中颜色的种类即...
make install的时候非root用户无法创建文件夹。
非 root 用户手动编译安装 GCC我们知道,关于 GCC 在 CentOS 下通过 yum 安装默认版本号,CentOS 5 是 4.1.2;CentOS 6 是 4.4.7;CentOS 7 是 4.8.3...
您好,请问您的表型数据文件如何整理出来的呢?可不可以请您讲一下细节呢?谢谢!
跑通GWAS,用这些脚本就够了最近跑通了一遍GWAS分析,全程在linux操作,虽然具体还有好多需要微调的地方,先把代码整理分享出来mark一下 前期准备 1.理论知识 强烈推荐百迈客云课堂课程GWAS生...
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GWAS流程作者:rapunzel0103 链接:https://www.jianshu.com/p/53362fe881cd 最近跑通了一遍GWAS分析,全程在linux操作,虽然具体...
作者:rapunzel0103 链接:https://www.jianshu.com/p/53362fe881cd 最近跑通了一遍GWAS分析,全程在linux操作,虽然具体...
文/婉兮 1 我有个同学名叫杨丽丽,名字普通、长相也普通,但她做过一件不普通的事儿:义无反顾嫁了一穷二白的学长,由穷人家的女儿,变成穷人的妻子。 这样的“弱弱联合”,在大部分...