1. 整合不同数据集中同一类细胞方法： 该方法来自一篇21年5月份的Nature：Cross-tissue organization of the fibroblast li...
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多个单细胞数据集整合方法 -
10X空间转录组之空间临近通讯分析stlearn进阶版新的一年，2022年，第一周，继cellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/845937ce248e]更新到3.0，辅助做空间生态位细胞通讯之...
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10X空间转录组高级分析进阶版作者，Evil Genius 单细胞研究已经非常多了，空转么，做的人也是相当的少，但是空转也有很多的个性化分析，培训的ppt放出来，大家随意查看。 ppt涉及的空间个性化分...
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复现NC文章华夫图(方块图)-华丽展示实验样本构成样本构成是实验的开端，也是后续分析的基础，所以样本信息在论文中需要详细展示，涉及到你实验的真实性和可重复性。一般样本构成可以使用AI做示例图，有些临床采样，可以使用柱状体的方...
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10X空间转录组聚类分析回顾之SpaGCN(结合基因表达信息、空间位置和形态学)隔离的第九天，孤独仍在，但亦师亦友，今天我们来回顾一下10X空间转录组聚类的分析软件SpaGCN，这个软件之前分享过，文章在10X空间转录组聚类分析之图卷积网络（graph ...
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单细胞RNAseq常规分析流程（10X）降维聚类，类型鉴定，差异分析 近年来，单细胞测序的成本逐渐降低，使得大众研究从组织水平转移到单个细胞水平的分析成为可能。本文主要是简单介绍一下SingleCellRNAseq...
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我眼中的barcodes.tsv.gz/features.tsv.gz/matrix.mtx.gz前段时间一直在用cellranger count进行单细胞测序数据的处理，不得不说Cell Ranger作为10X Genomics官方的单细胞数据处理工具，功能还是很强大的...
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超全总结--单细胞+空间转录组的整合分析方法总结这一篇我们做一个详细的总结，周五了，疫情还没结束，父母也都老了，有时候真的感觉身为儿子实在不孝，常年在外，回家很少，家里有点事父母也不会跟我这个儿子说，小病小灾的也舍不得去医...
