我们生活着的世界并非只有我们自己,而是有很多小于或大于我们的生物不断与我们交互着,有的让我们开心,有的使我们伤心。这就关系到一个本质的问题: 我是谁? 我是一个脑袋,一个躯体...
单细胞富集分析系列: 单细胞之富集分析-1:单细胞GSEA分析流程[https://www.jianshu.com/p/00f069cb239c] 1. 背景 Gene Se...
老师好,请教一个问题,从xena上下载tpm和tcga数据,已经log2(tpm+1),后面转录组差异,可以用limma包吗,困扰了很久。。。期待老师解答
救救孩子吧,GSVA分析都是做人的,有现成的人的数据集,可是其他物种的就惨了,很难下手!今天我们就说说小鼠,也是常见物种的GSVA分析,结合单细胞的数据! GSVA的作用不用...
WGCNA分析基于两个假设:1.相似表达模式的基因可能存在共调控、功能相关或处于同一通路,2.基因网络符合无尺度分布。基于这两点,可以将基因网络根据表达相似性划分为不同的模块...